Методические рамки исследований, основным объектом которых являются череп и посткраниальный скелет, сейчас настолько расширились, что один человек уже не в состоянии глубоко изучить краниологический материал с применением новых специфических методик. Поэтому среди исследователей новых направлений наметилась специализация в области палеоантропологии. Появились специалисты по дискретно варьирующим (неметрическим, качественным) признакам черепа, палеодемографы, палеопатологи и др. [66]. Существенный вклад в разработку метода и проблем палеопатологии внесла А. П. Бужилова. Под ее руководством был разработан оригинальный методологический подход к комплексному анализу археологических данных и патологических изменений скелета у представителей древних популяций, что позволяет реконструировать некоторые особенности образа жизни [64, 65 и др.]. На рубеже XX–XXI вв. была разработана специальная методика рентгеновского исследования – микрофокусная рентгенография с прямым многократным увеличением рентгеновского изображения. Для детального описания патологических изменений костной системы и дифференциальной диагностики заболеваний этот метод при изучении палеоантропологических материалов впервые в мировой практике был применен в 2008 г. [69]. Синтез методов физической антропологии, новых технологических приемов с историческим подходом к анализу палеопатологических данных позволил коллективу под руководством А. П. Бужиловой получить новую историческую информацию, имеющую большое значение не только для дальнейшего развития археологии и антропологии, но и для медицинской науки [64, 65, 67, 140, 247 и др.].
Активно развивающимся и перспективным направлением современной палеоантропологии является реконструкция типа физических нагрузок и двигательной активности древнего населения, связанная с родом их занятий. Некоторые структурные особенности костей плечевого пояса и нижних конечностей могут свидетельствовать о характере механических нагрузок на определенные группы скелетной мускулатуры, а значит, и об особенностях образа жизни и трудовой деятельности в зависимости от половой принадлежности индивидуума. Среди значительного разнообразия подходов одной из часто применяемых является методика оценки развития мускульного компонента (компонента мезоморфии). В отечественной палеоантропологии наибольшее распространение получила остеоскопическая программа В. Н. Федосовой и М. Б. Медниковой, которая заключается в изучении и детальной оценке рельефа кости в местах прикрепления мышц [161].
Совершенствуется методика изучения зубной системы человека, которая рассматривает ее особенности, возникающие в течение жизни и свидетельствующие о характере питания, гигиене полости рта, использовании зубов в качестве инструментов, что создает базу для реконструкции социальной и биологической среды обитания древних популяций. Методика