Основной объем бюджетных расходов на гражданские НИОКР контролируют четыре организации: Российская академия наук (РАН), Российское космическое агентство (Роскосмос), Федеральное агентство по промышленности и Федеральное агентство по науке и инновациям. Причем два последних агентства – исполнительные органы Министерства промышленности и Министерства образования и науки соответственно. Федеральное агентство по промышленности поддерживает НИОКР и инновационную деятельность преимущественно отраслевого характера и играет важную роль в распределении военных заказов в промышленности.
Федеральное агентство по науке и инновациям (ФАНИ) осуществляет государственную научную и инновационную политику, предоставляет государственные услуги, занимается охраной государственной собственности в сфере науки, технологий и инновационной деятельности. В его функции входит контроль над деятельностью Федеральных центров науки и высокой технологии (ФЦНВТ), государственных научных центров, уникальных научных установок, федеральных центров общего доступа и эксплуатации, ведущих научных школ, национальных информационных научных сетей, предоставление информации в области научной, научно-технической и инновационной деятельности.
Агентство не имеет отраслевой специфики и поддерживает науку и инновации различными инструментами (в первую очередь путем разработки ФЦНТП, а также создания научных парков, центров по трансферу и коммерциализации технологии, бизнес-инкубаторов), а также финансирует государственные исследовательские центры и мегапроекты.
Как было отмечено выше, часть бюджетных ассигнований на НИОКР распределяется на конкурсной основе через три государственных фонда:
• Российский фонд фундаментальных исследований (РФФИ),
• Российский гуманитарный научный фонд (РГНФ),
• Фонд содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере.
Российский фонд фундаментальных исследований был создан в 1992 г. Он поддерживает фундаментальные исследования во всех областях науки путем предоставления грантов на конкурсной основе. Основные функции Фонда состоят в поддержке лучших проектов в области фундаментальных наук, и поэтому отбор проектов основан на качественных оценках. РФФИ должен получать 6 % государственных расходов на гражданские НИОКР, однако в последние годы получает меньше. В 2006 г. Фонд профинансировал более 8000 исследовательских проектов, в которых участвовало более 730 различных академических институтов, университетов и промышленных исследовательских центров.
Из общего числа заявок Фонд принимает к финансированию примерно 1/3, что сопоставимо с аналогичными схемами в других странах (хотя европейские конкурсные системы более жесткие). При финансовой поддержке Фонда ежегодно публикуется