2.1. Ядерные флуоресцентные красители
Для облегчения идентификации клеток и тканей, а также для определения положения, формы клеток, их апоптозных изменений, фазы митотического цикла в исследованиях, проводимых с применением лазерной конфокальной микроскопии и обычной флуоресцентной микроскопии, используется окраска ядер клеток соответствующими флуоресцентными красителями. Окрашивание ядра клетки значительно облегчает ориентировку в изучаемых препаратах и позволяет регистрировать ряд морфологических параметров, связанных с функциональным состоянием клетки (размеры ядра и ядрышка, состояние хроматина).
При флуоресцентной микроскопии ядерную ДНК, как правило, окрашивают DAPI (4,6-диамидино-2-фенилиндолом). DAPI специфически связывается с ДНК и обладает синей флуоресценцией при возбуждении ультрафиолетовым светом ртутной лампы. При проведении конфокальной микроскопии флуоресценцию DAPI необходимо возбуждать ультрафиолетовым аргоновым лазером (360 нм) или мультифотонным (фемтосекундным пульсирующим) лазером. Диодный лазер (405 нм), которым обычно комплектуются бюджетные варианты конфокальных микроскопов, для этих целей непригоден. В этом случае вместо DAPI используют другие флуоресцентные красители. Их выбор в настоящее время достаточно широк (Приложение 1).
С точки зрения химической организации выделяют четыре основные группы флуоресцентных красителей, применяемых для окрашивания нуклеиновых кислот (НК):
1. Наиболее часто применяются цианиновые (полиметиновые) красители. Они имеют в качестве флуорофорной системы группы – СН=, образующие цепь сопряженных двойных связей с электронодонорной и электроноакцепторной группами на концах. Цианиновые красители образованы двумя ароматическими или азотсодержащими гетероциклическими кольцами, соединенными полиметиновой цепью двойных сопряженных углерод-углеродных связей. Выделяют симметричные (полиметиновые красители, содержащие одинаковые гетероциклы на концах полиметиновой цепи) и несимметричные. По количеству метиновых групп различают: цианиновые красители с одной метиновой группой – монометинцианины, красители с тремя метиновыми группами – триметинцианины (карбоцианины), симметричные цианиновые красители с более длинной цепочкой метиновых групп – полиметинцианины (поликарбоцианины). Также существуют мономерные и димерные цианиновые красители.
2. Фенантридины (этидия бромид, пропидия йодид ).
3. Акридины (акридиновый