В академии также преподавались французский и немецкий языки, верховая езда. Летом офицеры отправлялись в лагеря для практических занятий. На каждом курсе обучалось по 20–25 офицеров.
Теоретические курсы были поставлены в академии хорошо, для их преподавания привлекались лучшие силы. Военную историю читали известные историки М. И. Богданович и П. С. Лебедев. Курс охватывал события с глубокой древности (походы Александра Македонского) до современности (венгерский поход 1849 г.). Помимо слушания лекций, офицеры писали также сочинения по военной истории. Так, Игнатьевым были написаны сочинения «Причины войн греков с персами. Общий взгляд на греко-персидские, пелопонесскую и фиванскую войны», «Записка об истории применения артиллерии в войнах», «Записки по истории войны России и Франции в 1812–1815 гг.» и др. Два лучших его сочинения были даже опубликованы в «Военном журнале»: «Сравнение походов в Италии принца Евгения Савойского в 1706 г. и Бонапарта в 1800 г.» (1851 г.) и «Взгляд на постепенное изменение в образе действий русских против турок» (1852 г.).
Военную географию с 1844 г. преподавал Д. А. Милютин, сам окончивший академию в 1836 г. Одновременно он разрабатывал курс военной статистики, который стал читаться с 1847 г. и являлся лучшим курсом академии. Учащиеся академии, таким образом, получали помимо специального и неплохое военно-гуманитарное образование, которое позволяло им по окончании ее занимать разнообразные должности, в том числе военно-дипломатического характера. Они участвовали в различных военно-дипломатических миссиях, назначались командующими пограничными войсками, служили в военной администрации на вновь присоединенных землях. Военные агенты при российских посольствах и миссиях за рубежом, как правило, являлись выпускниками академии. Среди выпускников академии 40–50-х гг. можно назвать таких известных военных деятелей, как Д. А. Милютин, М. Д. Скобелев, Н. М. Пржевальский, Н. Н. Обручев, М. И. Драгомиров, М. Г. Черняев, Н. П. и А. П. Игнатьевы и др. Н. П. Игнатьев и М. Г. Черняев, кстати, учились на одном курсе и окончили академию в 1851 г. в числе двенадцати выпускников. В 1854 г. академию окончил Н. Н. Обручев. Игнатьев, прекрасно учившийся, окончил академию с большой серебряной медалью. Это была вторая такая награда, присужденная со времени первого выпуска офицеров в 1834 г. До Игнатьева подобную же медаль получил выпускник 1847 г. Н. Г. Казнаков. Судя по списку выпускников