Церкви при нем стали уничтожать, а на их месте строить мечети. Христиан обязали носить на себе тяжелые деревянные кресты, иудеев – железные шары. Он приказал разрушить храм Гроба Господня в Иерусалиме, что послужило толчком к началу крестовых походов. После бесчинств аль-Хаким против Церкви коптские христиане стали знак траура носить в черные повязки и пояса.
О странностях аль-Хакима ходило много легенд и слухов, достоверность которых трудно проверить. Говорили, что он проводил много времени над книгами, сторонился женщин, ходил с блуждающей улыбкой, никого не замечая, днем зажигал свечи, а ночью сидел в темноте. Он заставил торговцев открывать лавки по ночам и приказал перебить всех собак, досаждавших ему лаем, кроме охотничьих. Когда от болезни халиф уже не мог ездить на лошади, четыре человека днем и ночью носили его на носилках. В этих же носилках он принимал просьбы просителей, но требовал, чтобы они подходили к нему только с правой стороны и в своих прошениях писали не больше одной строчки и только на одной стороне листа.
За чаем он выслушивал поступавшие отовсюду обвинения в творимых им беззакониях и злодействах и никогда не отрицал того, что ему приписывали. Однажды на его пути через город поставили покрытую чадрой женщину с прошением в руках, где содержались оскорбления и поношения в адрес Хакима и его предков. Он приказал привести к себе женщину, но оказалось, что это была только фигура, сделанная из бумаги. Этот обман так сильно взбесил Хакима, что он приказал сжечь Каир и убить всех его жителей. При этом он делал вид, что ничего не знает о приказе, и на жалобы горожан, подвергавшихся нападениям солдат, отвечал, что те действуют без его ведома и против них следует защищаться. В городе начались сражения, во время которых сгорело четверть Каира; множество домов было ограблено, жителей – убито, женщин – обесчещено.
Историк Джувейни сообщал о его необычной привычке писать письма собственной рукой. «В одних говорилось: «Вручить подателю сего письма тысячу динаров, или такой-то город, или такое-то дорогое платье», а в других: «Убить подателя сего письма, или забрать у него столько-то денег, или отрезать у него такую-то конечность, или подвергнуть его пыткам». И он запечатывал эти письма сургучом, или амброй, или глиной, и в дни аудиенций разбрасывал их повсюду, и все хватали их, каждый соответственно своей судьбе, и нес ли их местному правителю, и каково бы ни было приказание, изложенное в письме, оно немедленно исполнялось».
По характеру аль-Хаким был крайне неуравновешен, и приближенные часто страдали от необъяснимых вспышек его гнева. Своего любимца чернокожего евнуха Айна он щедро засыпал подарками, но мог в приступе бешенства отрубить ему руку или вырезать язык. Ударившись в благочестие, он отменил все свои звания и титулы, стал ездить в простой одежде на осле, закрыл дворцовую кухню, чтобы