В советское время все иконы из Николаевского собора и теплой церкви были сожжены на территории монастыря, образ же святителя сохранился, может быть, именно потому – так считают исследователи, – что находился в скитской церкви.
О написании копий с чудотворной иконы в истории монастыря не упоминается, поэтому, возможно, древнюю, явленную в лесу икону, обрел в наше время отец Иона Пирогов в селе Халиманово Бахмачского района Черниговской области у благочестивой женщины, хранившей много икон из разных разрушенных храмов и монастырей. Внимание отца Ионы привлекла икона святителя Николая, стоявшая в чулане. Женщина рассказала, что эта икона из Батуринского монастыря, храмовая. Отец Иона перенес икону святителя в храм Воскресения Христова в Батурине. 30 мая 2000 года был открыт Батуринский Николо-Крупицкий женский монастырь, куда по благословению митрополита Черниговского и Нежинского Антония в сентябре 2001 года торжественно перенесли образ Николая Чудотворца. Образ святителя частично реставрировали в Киеве, а перед празднованием перенесения мощей святого Николая Чудотворца 19 мая 2002 года он прибыл в обитель.
Монастырь был основан еще в XII, восемь веков назад. Во время татаро-монгольского нашествия монахи упрямо обороняли монастырь от захватчиков, вскоре закончились запасы продовольствия и монахи стали молить Бога помочь им. Бог просыпал на монастырь крупу (манну небесную) и спас защитников от голодной смерти. В память о Чуде, монастырь с тех пор стал прозываться Крупицким.
Николаевским монастырь называется потому, что на этом месте было явление иконы Николая Чудотворца главной святыни монастыря. Часть этой пищи, сохранялась до
XVIII века – вплоть до времени восстания Мазепы. Об этом чуде написал на напрестольном Евангелии святитель Димитрий Ростовский. В архивах 1767 года обнаружили донесении архимандрита обители Варсонофия, по словам которого «в тогдашнее де время столь множество круп с неба спало, что все могли в гладе себя довольствовать и те крупы содержаны были в серебряном ковчежце даже до времени гетмана Мазепы. Как по измене город Батурин разорен, то монастырь в разорении ж был и кем те крупы взяты, неизвестно».
Возвращаясь с Куликовской битвы, отслужили молебен на месте чудесного явления иконы, и благоверный князь Димитрий повелел воздвигнуть здесь храм и иноческую обитель во имя Святителя Николая. «И воздвигну ту обитель славну, и удовольствоваю к пропитанию всем потребным нескудно», сообщает монастырская книга.
Кондак 3 (из Акафиста)
Силою, данною ти свыше, слезу всяку отъял еси от лица люте страждущих,