Чекисты оказывали существенную помощь военному командованию в наведении порядка на всех видах транспорта, обеспечивали надлежащую безопасность коммуникаций. Достаточно сказать, что только на участок дороги от Ладоги до Тихвина абверкоманда-204 забросила 12 диверсионных групп с заданием выведения его из строя. В их состав входило 54 хорошо обученных и снабженных всем необходимым диверсанта. Ни одной из этих групп не удалось выполнить задание, все он были задержаны и разоблачены. Немалая заслуга работников НКВД есть и в том, что 15 января 1942 года была увеличена норма выдачи продуктов питания населению.
С конца мая 1942 года возобновились водные перевозки по Ладожскому озеру, которые потребовали от людей не меньше мужества, чем ледовые. За навигацию было доставлено около 800 тыс. тонн различных грузов. В июне 1942 года вступил в строй проложенный по дну озера трубопровод для горючего, а еще через два месяца по проведенному через озеро кабелю город получил энергию Волховской ГЭС. Учитывая возрастающую значимость коммуникаций через Ладогу, руководство Управления в августе 1942 года откомандировало в помощь чекистам-транспортникам дополнительно 45 опытных сотрудников из других подразделений УНКВД.
Наряду с оперативной работой по обслуживанию объектов военной промышленности была усилена работа на предприятиях пищевой промышленности города. Для этого была создана специальная группа для оперативного обслуживания торговых учреждений, организаций и предприятий пищевой промышленности.
В связи с нехваткой топлива чекисты, как и другие жители города, направлялись на лесозаготовки. К зиме 1943–1944 годов было заготовлено 4 тыс. кубометров дров для отопления здания Управления и для обеспечения ими семей погибших сотрудников, фронтовиков и чекистов, работавших в тылу врага.
Зимой 1941 года в Ленинграде проводился сбор пожертвований и денег в фонд обороны. К 1 января 1942 года работники Управления внесли денег и облигаций госзаймов на 1 миллион 173 тыс. 800 рублей, а также передали 250 золотых и серебряных вещей.
Командование Ленинградского фронта и блокированный город ежедневно и ежечасно нуждались в точных сведениях о силах врага и его замыслах. Эту задачу наряду с армейской разведкой решали оперативные сотрудники контрразведки Ленинградского, Волховского фронтов и Ленинградского управления госбезопасности. Только люди большой силы воли и психологической выдержки могли совершать переходы через линию фронта в тыл противника, вести разведку в условиях, при которых малейшая неосторожность могла привести к гибели.
Осенью 1941 года к моменту