Чибисов И. Ф. – с марта 1919 года по август 1920 года
2-я армия
Русанов Г. А. – июль 1920 года
3-я армия
Русанов Г. А. (Военный контроль) – июнь 1918 года
Самсонов (Бабий) Т. П. (Военный контроль) – с ноября 1918 года по январь 1919 года
Самсонов (Бабий) Т. П. – с января по май 1919 года
Бреслав Б. А. – с мая по ноябрь 1919 года
Кацнельсон З. Г. (врио) – с октября по ноябрь 1919 года
Быстрых Н. М. – декабрь 1919 года
Залин (Левин) Л. Б. (и. о.) – 1920 год
Дукельский В. С. – с июня по 28 ноября 1920 года
Опанский И. К. – с ноября 1920 года по 1920 год
Тунгусов А. Г. – с 1920 по 1921 годы
Трофимов А. В. – 1921 год
4-я армия
Петровский П. Г. (председатель ЧК) – с июля по ноябрь 1918 года
Горин Я. Г. – с ноября 1919 года по февраль 1920 года
Сылна (Звердис) Р. Я. – март 1920 года
Горин Я. Г. – с мая по август 1920 года
Клявин Я. Ю. – 1920 год
Чибисов И. Ф. – с ноября по декабрь 1920 года
Каминский И. И. – с декабря 1920 года по март 1921 года
Михельсон А. И. – март 1921 года
Малецкий И. М. – 1921 год
5-я армия
Гузаков П. В. (председатель ЧК, Военконтроль) – май 1918 года
Павлуновский И. П. – август 1918 года
Гузаков П. В. – с 1919 по 1920 годы
Сухачев К. В. – с 1919 по январь 1920 года
Марцинковский А. П. – 1920 год
Николаев А. П. – с мая по июль 1921 года
Каган Л. И. – с июня 1921 года по март 1922 года
Алексеев В. М. – с марта 1922 года по 1922 год
6-я армия
Эйдук А. В. (председатель ЧК) – с сентября по октябрь 1918 года
Воронцов И. А. (председатель ЧК) – декабрь 1918 года
Воронцов И. А. – с апреля 1919 года по апрель 1920 года
Быстрых Н. М. – с мая по июль 1920 года
Горин Я. Г. – с августа по декабрь 1920 года
Быстрых Н. М. —с декабря 1920 года по февраль 1921 года
Воронцов И. А. – февраль 1921 года
7-я армия
Путовский Ч. А. (председатель ЧК)
Пурышев А. А.
Харитонов М. М. – с ноября 1919 года по февраль 1920 года
Комендантский А. – февраль 1920 года
Даубе В. П. – 1920 год
Рунич Н. Ф.
8-я армия
Бельский (Левин) Л. Н. – с сентября 1919 года по сентябрь 1920 года
Пугановский – 1921 год
Майдер (Пунке) В. А. – с ноября 1918 года по январь 1919 года
9-я армия
Богров С. Е. – с декабря 1919 года по май 1920 года
Медведев М. Е. – апрель 1920 года
Ляшенко Ф. Ф. – с апреля по май 1920 года
Чернобровый В. Н.
Коган Л. Н. – с июля по август 1920 года
Атарбеков Г. А. – с августа по октябрь 1920 года
Добрис – с октября по декабрь 1920 года
Литвинов – с декабря 1920 года по август 1921 года
Гончуков И. А. – с августа по декабрь 1921 года
Аботин Н. И. – с января по июль 1921 года
10-я армия
Генкин И. Б. – с августа 1919 года по апрель 1920 года
Соснин Л. А. – апрель 1920 года
Дижбит А. М. – 1920 год
Фомин