Снейк докладывает о своих галлюцинациях. Откуда они? Наоми говорит, что это – некое последствие, отдача (feedback) от действий Мантиса. «Значит, это был Мантис», – заключает Солид. Видимо, Богомол каким-то образом повлиял на девушку-солдата…
…Вскоре после этого события Змей добирается до Бейкера; тот окружен растяжками и взрывчаткой С4. И тут на место выходит экстравагантно одетый пожилой мужчина с револьвером Colt Single Action Army; он представляется как Револьвер Оцелот. «Так ты тот, о котором босс столько говорит. Сейчас увидим, соответствуешь ли ты легендам о себе», – говорит он. Оцелот – первый босс игры; бой с ним, как правило, оказывается несложным, игроку нужно всего лишь ждать момента, когда у противника закончатся патроны, и он начнется возиться с перезарядкой своего револьвера. После окончания боя Оцелот говорит: «Ты весьма неплох!47 Как я и ожидал от человека с тем же позывным, что и у босса. Но это была всего лишь разминка…» И тут из невидимости по Оцелоту наносится удар мечом, который отрубает ему руку; Оцелот кричит от боли и скрывается…
Выключив стелс-камуфляж, к Снейку подходит неизвестный Киборг-ниндзя (Cyborg Ninja) в экзоскелете; его лицо закрыто специальным шлемом, в его руках – меч. «Кто ты?» – спрашивает его Змей. «Я – такой же, как и ты. У меня нет имени», – отвечает Ниндзя, после чего с ним случается странный припадок, и он сбегает неизвестно куда…
У героя появляется возможность начать разговор с Бейкером. Президент ArmsTech предполагает, что некий Джим (Jim) из Пентагона послал Солида сюда. Бейкер говорит, что выдал код, хоть у него и были импланты в мозгу, блокирующие чтение мыслей; его жестоко пытал Оцелот, и он не смог противостоять пыткам. Такие же импланты имелись и у Андерсона, но тот сказал, что Мантис прочитал его мысли; все это выглядит очень странно. Бейкер интересуется состоянием дел у шефа DARPA; Снейк сообщает, что Андерсон умер от сердечного приступа. В ответ Бейкер начинает бить Снейка своим костылем, полагая, что некий Джим послал Солида убить его; Джим нарушил свое обещание… Снейк говорит ему, чтобы тот успокоился: у Андерсона был сердечный приступ или что-то вроде того… «Ох, не будь глупцом», – отвечает Бейкер. У него нет ключ-карты для обхода запуска, он отдал ее женщине, находящейся в тюремной камере; она отказалась участвовать в восстании, и поэтому оказалась там. «Наверное, это племянница полковника!» – полагает Снейк. Бейкер разговаривал с ней по кодеку, но теперь забыл ее частоту; он говорит, что частоту можно найти на обратной стороне коробки с игрой – мы видим очередной слом четвертой стены и отсылку к Metal Gear 2.
Есть ли другие способы остановить запуск? Бейкер советует найти Хала Эммериха (Hal Emmerich), лидера проекта Метал Гир «Рекс». Он – гений инженерии, но немного «странный малый»; он должен знать, как остановить запуск ракеты на Метал Гире. Эммерих находится в здании, в котором хранятся ядерные боеголовки, расположенном на севере (а где же еще). «Но зачем