В июне 2000 года, вскоре после начала работы кабинета Шредера, состоялась конференция с участием правительственных чиновников и представителей ведущих энергетических концернов страны. На конференции было подписано юридически обязывающее соглашение о поэтапном отказе ФРГ от атомной энергетики (так называемый Атомный консенсус). Соглашение приобрело юридически обязывающий характер в 2002 году в виде изменений в закон об атомной энергии и предусматривало закрытие последней атомной электростанции в ФРГ не позднее конца 2021 года[102]. Для каждой из действовавших на тот момент на территории страны атомных электростанций была установлена фиксированная квота электроэнергии, после исчерпания которой станция должна была быть выведена из эксплуатации. Соглашение представляло собой довольно болезненный компромисс как для правительственной коалиции, так и для атомной промышленности. Правительству пришлось согласиться на продление работы недавно построенных АЭС еще на 20 лет, а атомное лобби было вынуждено пойти на немедленное закрытие устаревших станций. И хотя Атомный консенсус подвергся нападкам и приверженцев, и противников атомной энергии, он стал важной вехой истории общественного развития современной Германии, ибо помог сблизить противоположные точки зрения по поводу будущего атомной энергетики в ФРГ. Кроме того, соглашение было первым документом, юридически закрепившим сроки отказа от использования ядерной энергии.
В 2000 году доля атомной энергетики в совокупном энергобалансе ФРГ составляла 25 %[103]. Таким образом, перед руководством страны была поставлена задача заместить эту долю другими источниками энергии в течение 20 лет. Именно тогда и было принято решение сделать выбор в пользу широкомасштабного развития альтернативной энергетики. Одновременно правительство Шредера приступило к выполнению положений Атомного консенсуса о закрытии выработавших свой ресурс атомных электростанций. В 2003 году была закрыта АЭС в Штаде, проработавшая свыше 30 лет и практически выработавшая эксплуатационный ресурс. В 2005 году была выведена из эксплуатации АЭС в Обригхайме, проработавшая 36 лет.
Дальнейшей реализации Атомного консенсуса помешали внеочередные общефедеральные парламентские выборы 2005 года. В ходе выборов ни одна политическая партия не сумела добиться убедительного большинства в парламенте. В результате было сформировано коалиционное правительство из право- и левоцентристских партий под руководством Ангелы Меркель. Составившие правительственную коалицию партии имели непримиримо разные точки зрения по поводу перспектив ядерной энергетики в стране, поэтому практическая реализация положений Атомного консенсуса застопорилась. К тому же под влиянием модных в те годы дебатов о глобальном потеплении и о роли ископаемых энергоносителей в усилении парникового эффекта в Германии заговорили о ренессансе ядерной энергетики. США и ряд азиатских стран