Управление Иерусалима находилось в руках первосвященника и Синедриона. Площадь Иерусалима в это время составляла около 2,6 кв. км, население от 30 до 100 тысяч. Иерусалимом правил младший сын Ирода Великого – Ирод Антипа, в правление которого по приказу римского прокуратора Понтия Пилата римскими легионерами был казнен Иисус Христос.
В нижнем городе располагались главные городские рынки, и был густонаселенный квартал. В Верхнем городе жила аристократия и зажиточные горожане, находились дворцы первосвященника и хасмонейской знати, дворец Ирода с башнями высотой 40, 36 и 21 м. Широкий мост соединял Храмовую гору с Верхним городом, а монументальная лестница с Нижним городом. Над всем городом возвышалась Храмовая гора, окруженная массивной стеной с колоннадами. Сам Храм был окружен еще одной стеной, достигавшей высоты 45 м и блиставшей белым мрамором с позолотой. За городскими стенами находился иерусалимский некрополь с гробницами царей, священников, Судей (членов Синедриона). Осенью 66 г. уже н.э. израильтяне опять подняли восстание. И уничтожили небольшой римский гарнизон, находившийся в Иерусалиме. Тогда римляне сначала под водительством Веспасиана в 66 г., а потом в 70 г. под командованием Тита после многомесячной осады с боем захватили Храм и сожгли его, убили большинство жителей города, остальных казнили или продали в рабство, а город разрушили. Уцелели лишь три башни цитадели Ирода. Затем римляне взялись и за остальных евреев в стране, обрушив кровавые репрессии, а на Храмовой горе воздвигли языческий храм.
Затем через 50 лет после нового восстания Бар-Кохбы (три года город находился в их руках) в 135 г. римляне вновь захватили город, на месте Храма воздвигли святилище Юпитера, построили на развалинах города римскую колонию Элия Капитолина, на месте Святая святых установили конную статую Адриана, в город стали прибывать христианские паломники, появилась христианская община, а евреям жить запрещалось.
В 324 г. византийский император Константин I овладел страной, и город приобрел в основном христианский облик, на месте предполагаемого захоронения Иисуса была воздвигнута церковь Гроба Господня. Лишь в 438 г. благодаря заступничеству императрицы Евдокии