Протеом – это глобальная информационная структура клетки, материализованная в форме нормализованной сигнальной интенсивности (НСИ) ее белков и включающая все информационные составляющие ее компартментов, а также специализированных и эффекторных функций». Поэтому для разработки и создания персонифицированного противоопухолевого препарата был выбран уникальный информационный материал – «протеом» соматической клетки, возможности использования которого можно изучить в монографии А. С. Брюховецкого «Клиническая онкопротеомика: протеом-основанная персонифицированная противоопухолвеая клеточная терапия» (М., 2013. – Изд. Полиграф Плюс. – 404 с.)
По протеому можно идентифицировать неопластический кариотип и злокачественный или доброкачественный фенотип опухолевой клетки и показать его гистологическую и иммунохимическую специфичность. С другой стороны, динамичность протеома здоровой соматической клетки очень конкретна и отражает основные этапы ее судьбы. Временные изменения профиля протеома здоровой соматической клетки характеризуют фазу ее клеточного цикла, стадию дифференцировки, функционального состояния и динамических эффекторных тенденций (пролиферация, апотоз, миграция, ангиогенез и т.д.) и главное – он отражает текущее состояние белков в данный момент времени, которое полностью коррелирует с ее транскриптомом. Другими словами, «протеом» здоровой соматической клетки очень жестко привязан к ее морфологии и функциональному состоянию и имеет специфичное профилирование на уровне «транскриптома». У каждого протеомного профиля здоровой соматической клетки имеется запрограммированный в геноме транскриптом, возникающий в процессе запрограммированной экспрессии генов и формирования внутриклеточного сигналинга. То есть определенные изменения протеома здоровой клетки сопровождаются очень стабильными и генетически детерминированными белковыми профилями экспрессирующих генов (транскриптомным профилированием). Эта особенность принципиального отличия генома, транскриптома и протеома РСК и опухолевой клетки от подобных информационных показателей здоровой клетки и не позволяет опираться на транскриптом ОК и РСК при разработке персонифицированной противоопухолевой терапии. Каждый раз при исследовании транскриптома ОК и РСК результаты микроматричного анализа будут существенно различаться. Таким образом, обобщая вышеизложенное, можно утверждать, что наиболее стабильным информационным параметром здоровой соматической клетки