К середине 1919 г. численность войск ВОХР увеличилась до 125 тыс. человек, из которых 40 батальонов входило в состав войск ВЧК[424].
1 сентября 1920 г. СТО сделал новый шаг к объединению всех войск вспомогательного назначения. По предложению Ф.Э. Дзержинского СТО постановил объединить войска железнодорожной обороны, караульные части, находившиеся в ведении ВГШ и НКЮ, части железнодорожной и водной милиции, а также все другие войска, имеющие своим назначением охрану, поддержание порядка и обеспечение выполнения распоряжений правительства, с войсками ВОХР как на фронте, так и в тыловых округах в один общий вид войск внутренней службы (ВНУС). Командующий войсками ВНУС непосредственно подчинялся НКВД и Главнокомандующему Вооруженными силами Республики[425]. Для войск внутренней службы, обслуживавших ВЧК и местные ЧК, предусматривались особые штаты, выработанные коллегией ВЧК[426].
С возложением по постановлению СТО 24 ноября 1920 г. охраны государственных границ на особый отдел ВЧК[427] ему для несения пограничной службы придавались соответствующие воинские части (первоначально войск ВНУС, затем войск ВЧК, а позже Красной армии).
Окончание Гражданской войны в Европейской России поставило вопрос о сокращении и реорганизации Красной армии. В декабре 1920 г. Ф.Э. Дзержинский принимал участие в совещании партийных, советских и военных деятелей, созванном РВСР с согласия ЦК РКП(б) и СНК для обсуждения проекта реорганизации армии. По вопросу войск ВНУС совещание признало целесообразным упразднить эти войска как самостоятельные и передать их РВСР, за исключением войск, обслуживавших чрезвычайные комиссии.
19 января 1921 г. СТО принял подготовленное Ф.Э. Дзержинским и Э.М. Склянским постановление о передаче войск ВНУС в военное ведомство и об организации войск ВЧК. Пункт 8 этого постановления гласил: «Все части и отряды, состоящие в ведении ВЧК, свести в особый вид войск, именуя их “войсками ВЧК”, подчинив их во всех отношениях ВЧК». Управление железнодорожной и водной милиции было также изъято из ведения войск ВНУС и передано ВЧК.
Кроме обслуживания нужд чрезвычайных комиссий СТО возложил на войска ВЧК охрану границ, железнодорожных станций и пристаней, за исключением военно-продовольственных складов и грузов, мостов и электростанций[428].
21 января 1921 г. коллегия ВЧК утвердила «Основные положения организации войск ВЧК». Войска состояли из батальонов и бригад и предназначались для обслуживания местных ЧК, охраны границ, транспорта, железнодорожных станций и сооружений, а также выполняли задачи по борьбе с бандитизмом и обеспечению общественного порядка. Руководство войсками осуществлял председатель ВЧК через командующего