Нормативные правовые акты Президента РФ. Кардинальные изменения организационного порядка, новый этап формирования уголовно-исполнительного права следует отнести ко времени принятия Указов Президента РФ от 8 октября 1997 г. № 1100 «О реформировании уголовно-исполнительной системы Министерства внутренних дел Российской Федерации» и от 28 июля 1998 г. № 904 «О передаче уголовно-исполнительной системы Министерства внутренних дел Российской Федерации в ведение Министерства юстиции Российской Федерации», согласно которым УИС МВД России с входящими в ее состав центральным и территориальными органами, учреждениями, предприятиями, организациями и имуществом, используемым ею в своей деятельности, с 1 сентября 1998 г. была передана в ведение Минюста России. Согласно Указу Президента РФ от 9 марта 2004 г. № 314 «О системе и структуре федеральных органов исполнительной власти» была образована ФСИН России, руководство которой осуществляет Президент РФ. Указ Президента РФ от 13 октября 2004 г. №1314 «Вопросы Федеральной службы исполнения наказаний» определил основные задачи, функции и полномочия этого нового федерального органа исполнительной власти. Все перечисленные документы повлекли за собой принятие многочисленных нормативных правовых актов в сфере исполнения уголовных наказаний.
Важную роль не только в совершенствовании механизма реализации конституционных полномочий Президента РФ по осуществлению помилования, но и в обеспечении участия органов государственной власти субъектов РФ и общественности в контроле за деятельностью учреждений и органов, исполняющих уголовные наказания, играет Указ Президента РФ от 28 декабря 2001 г. № 1500 «О комиссиях по вопросам помилования на территориях субъектов Российской Федерации». Этим Указом изменен порядок рассмотрения ходатайств осужденных и лиц, имеющих судимость, о помиловании. Вместо Комиссии по вопросам помилования при Президенте РФ на территориях субъектов РФ были образованы региональные комиссии.
Нормативные правовые акты Правительства РФ. Выделяют две группы правительственных актов по вопросам исполнения уголовных наказаний. Одна из них включает постановления, направленные на обеспечение жизнеспособности системы учреждений и органов, исполняющих уголовные наказания, ее нормальное функционирование на современном этапе. Другая группа состоит из нормативных актов, принятие которых делегировало Правительству уголовно-исполнительное законодательство.
Нормативные правовые акты первой группы принимаются по текущим вопросам деятельности учреждений и органов, исполняющих уголовные наказания, когда требуется решение