6 июня были спешно внесены, приняты и одобрены два парламентских акта. Один был «для лучшего предотвращения и наказания попыток соблазнить лиц, служащих в войсках Его Величества на море или на суше, от их долга и верности или склонить их к мятежу или неповиновению»; а другой был «для более эффективного ограничения сношений с экипажами некото-рых кораблей Его Величества, ныне находящихся в состоянии мятежа и восстания, и для эффективного подавления такого мятежа и восстания».
Во исполнение намерения властей подавить любой ценой вспышку мятежей, по обеим берегам Темзы были возведены новые батареи; буи в ее устье были сняты; в разных точках были подготовлены печи для нагрева ядер. «Нептун» (98) коммодора Эразмуса Гауэра, «Ланкастер» (64), «Эджинкорт» (64) и несколько канонерских лодок, которые стояли около Грейвсенда, получили приказ спуститься вниз по реке и атаковать мятежников. Мятежники, чувствуя, что конец приближается, начали переговоры через графа Нортеска, капитана линейного корабля «Монмут»; но все еще изображали стойкость и непоколебимость. Их предложения были отвергнуты; и подготовка к их подавлению силой оружия была почти завершена, когда 9 июня стало очевидно, что восстание вот-вот выдохнется. В тот день «Рипалс» и «Леопард» ускользнули из эскадры мятежников; последний поднялся по Темзе, но первый, к сожалению, сел на мель и был обстрелян «Монмутом» и «Директором». Следующей ночью «Ардент» также покинул строй мятежных кораблей, хотя и он был обстрелян «Монмутом». И на нем, и на «Рипалсе» несколько человек получили ранения.
10 июня несколько кораблей спустили красный флаг, и речное движение было возобновлено. 12 июня другие корабли выразили желание подчиниться правительству; и к вечеру того дня у мятежников осталось всего семь кораблей. Рано утром 13 июня «Агамемнон», «Стандарт», «Нассау», «Айрис» и «Вестал», после того как на большинстве из них произошли кровавые бои между сторонниками и противниками мятежа, укрылись либо на Темзе, либо под пушками Ширнесса; и позднее в тот же день основная масса мятежников, включая даже команду «Сэндвича», объявила о своей склонности подчиниться, если будет предоставлено всеобщее помилование.
Утром 14 июня «Сэндвич» попал под обстрел форта Ширнесс, и вице-адмирал Бакнер, отправив на его борт шлюпку, полную солдат, добился ареста Ричарда Паркера и человека по имени Дэвис, который был его флаг-капитаном, а также около тридцати других зачинщиков мятежа. Один из них, по имени Уоллес, чтобы избежать ареста, покончил с собой. Паркера 22 июня на борту «Сэндвича» судил военный трибунал. Суд продолжался несколько дней и закончился приговором к смертной казни. Он был казнен 29 июня на борту «Сэндвича», признав справедливость приговора. Затем судили других мятежников. Многие были казнены; несколько человек были подвергнуты порке; некоторые были заключены в тюрьму в Маршалси; и некоторое количество заключенных оставалось под стражей