При имеющемся очевидном сходстве в применяемых при их практической реализации подходах и методах, они имеют различные конечные цели и решаемые задачи – "…установление в отношении объектов оценки рыночной, кадастровой, ликвидационной, инвестиционной или иной предусмотренной федеральными стандартами оценки стоимости…" (ст.3 ФЗ ОДРФ) в первом случае и "…оказание содействия судам, судьям, органам дознания, лицам, производящим дознание, следователям в установлении обстоятельств, подлежащих доказыванию по конкретному делу, посредством разрешения вопросов, требующих специальных знаний…" (ст. 2 ФЗ ОГСЭД), в том числе и установление стоимости имущества – во втором. Исходя из этого, отличаются основания их проведения – "Договор на проведение оценки объекта оценки" или определение суда (ст.9 ФЗ ОДРФ) и, соответственно, "Постановление или определение о назначении судебной экспертизы" (ст. 19 ФЗ ОГСЭД), порядок ее проведения, итоговые документы – "Отчет об оценке объекта оценки" (ст. 11 ФЗ ОДРФ) и "Заключение эксперта" (экспертизы) (ст.9, 25 ФЗ ОГСЭД, ст.80, 204,206 УПК, ст. 86 ГПК, ст. 86 АПК, ст. 26.4 КоАП), а также существенные требования к их содержанию и оформлению.
Следует особо отметить, что оценочная деятельность требует членства оценщика в одной из саморегулируемых организаций оценщиков (ст. 15 ФЗ ОДРФ), предъявляющих дополнительные требования к его квалификации (ст. 21.2 ФЗ ОДРФ), а судебная экспертиза может быть проведена как государственными судебными