Папа Римский Вигилий (лат. Vigilius PP,? —555 гг.), узнав об издании «Трёх глав», пришёл в ярость. Он немедленно отлучил от церкви константинопольского патриарха Мину (греч. Πατριάρχης Μηνάς,? —552 гг.). Церковь вновь оказалась на грани раскола. Ситуация обострялась ещё и ситуацией в Италии, где византийцы теряли позиции (об это мы вам расскажем позже), и Юстиниану как никогда была необходима поддержка Папского престола. Императору пришлось действовать грубо, возможно, с подачи Феодоры (которая сама возвела Вигилия в сан Папы Римского). В 545 году византийские гвардейцы схватили папу и доставили его в Константинополь. В византийской столице, находясь под постоянным давлением Юстиниана и, в особенности, Феодоры, Вигилий согласился публично осудить «Три главы» и вернуть патриарха Мину в лоно церкви. 11 апреля 548 года папа издал официальный указ, где осуждаются «Три главы».
Вигилий
Спор о «Трёх главах» на этом, к сожалению, не закончился. В 550 году Вигилий официально аннулировал своё осуждение «Трёх глав», ухудшились отношения между папой и императором. После этого Вигилий повторно отлучил от церкви патриарха Мину. Тогда началось реальное преследование папы. Юстиниан приказал схватить Вигилия, и последнему пришлось скрываться в церкви, но гвардейцы силой выволокли опального папу оттуда. Вигилий пытался оказать им сопротивление и едва не погиб в потасовке. Вокруг церкви уже собрались люди и публично осуждали солдат за такое обращение с божьим человеком, и гвардейцам пришлось уйти без Вигилия.
На следующий день к церкви подошёл ещё один отряд, возглавляемый Велизарием. Велизарий передал папе глубочайшие сожаления императора по поводу случившего и сказал, что теперь папе ничего не угрожает, и сопроводил Вигилия до его резиденции. Но, оказавшись внутри здания, Вигилий понял, что выпускать его не собираются. Тогда одной декабрьской ночью 551 года он решил сбежать. Вигилий смог выпрыгнуть из окна и добраться до порта, там он нанял лодку и переправился через Босфор. Затем он отправился в Халкидон, где пробыл до весны, но затем ему всё же пришлось вернуться в Константинополь.
«Преображение Господне». Мозаика церкви Сант-Аполлинаре-ин-Классе. Равенна
Юстиниан объявил о намерении созвать Вселенский собор в Константинополе, и в византийскую столицу съезжались епископы из разных частей христианского мира. 5 мая 553 года открылся Пятый Вселенский собор. На нём собрались 168 епископов, и по итогам собора было принято всеобщее осуждение «Трёх глав». Папа Вигилий отказался принять это решение, так как на соборе присутствовали лишь два епископа из Рима, и большинство было с востока.
Однако императору поддержка папы была уже не нужна. В 552 году готы были разгромлены, и Италия вернулась под контроль Византии.