В тех случаях, когда по внешним признакам и подъемному материалу невозможно получить необходимые сведения о памятнике или нужна дополнительная информация (например, о его стратиграфии, мощности культурных отложений, их датировке, количества включений), производится зачистка вертикальных откосов и закладываются разведочные шурфы. Данные работы гораздо более трудоемки, чем визуальный поиск, но они позволяют проводить обследование объектов, скрытых под землей. Без особой необходимости их делать не следует, так как они приводят к порче памятника и ускоряют его разрушение. Зачистки и закладку шурфов нужно производить на основании Открытого листа формы № 2 после топографической съемки памятника с точной привязкой их местоположения на плане.
При производстве земляных работ в процессе разведки необходимо стремиться к минимальному нарушению культурного слоя, избегая вскрытия площадей и ограничиваясь зачисткой и фиксацией уже имеющихся обнажений: обрывов, осыпей, откосов, стенок ям, котлованов или других повреждений. По этой причине место для закладки разведочных шурфов выбирается так, чтобы а) получить наиболее волную информацию при наименьших затратах, б) свести к минимуму повреждения памятника (следует помнить, что шурф может попасть на место сложного комплекса, который можно понять только путем полного его раскрытия). На поселениях, планировка которых (или внешние очертания) может быть определена по рельефу, шурфы ориентируются бортами в соответствии с направлением сторон памятника. На поселениях с неясной планировкой – по сторонам света. Форма и размеры шурфов выбираются в соответствии с решаемой задачей и характером памятника, но величина шурфа должна быть не меньше 1×1 м. Разведочные шурфы и траншеи на земельных наделах закладываются поперек межевых стен, валов, плантажа, дорог между наделами – независимо от их ориентировки.
Обычно производятся небольшие по площади пробные шурфы, и грунт из них исследуется на содержание артефактов или информативных биологических остатков. В силу ограниченной площади шурфы, закладываемые в разведочных целях, часто содержат очень немногочисленные находки, достаточные лишь для того, чтобы установить наличие на этом месте памятника. Для того же, чтобы получить о нем более детальное представление, необходимо в дальнейшем предпринять раскопки. В тоже время зачистка стенок современных ям, траншей, окопов, перекопов и т. д., а на памятниках с абразионными участками – зачистка обрывов может дать достаточно полную информацию о стратиграфии и хронологии поселения. Зачистка на вертикальных клифах производится так же, как и зачистка бортов раскопа. Зачистка на размываемых склонах ведется в два этапа. На первом после предварительной разметки склона на квадраты удаляется вся осыпь и зачищается неповрежденная поверхность склона до выявления