6 сентября В.И. Ленин, опять же с подачи Сталина, настоятельно потребовал от наркома по морским делам отправить на Каспий «несколько миноносцев легкого типа и штуки две подводных лодок».
Вскоре на Волгу из состава Балтийского флота были посланы три миноносца: «Прочный», «Прыткий» и «Ретивый».
Во время своего пребывания В Царицыне, Сталин имел некоторое отношение к уничтожению Черноморского флота.
К лету 1918 года в Причерноморье сложилась с критическая военно-политическая ситуацию. Германская армия, вопреки параграфам Брестского мира, продолжила продвижение вглубь России, заняв Крым и Севастополь. Во избежание захвата флота, часть кораблей Черноморского флота покинула Севастополь и перешла в Новороссийск, который был совершенно не приспособлен для долго пребывания целой эскадры. Более того, дальше кораблям Черноморского флота идти было просто уже некуда. Немцы потребовали возвращения ушедших кораблей, грозя разрывом Брестского мира и оккупацией новый регионов России.
Тем временем, и так непростую военно-политическую ситуацию в Северном Причерноморье еще больше осложнила авантюра руководителей Советской Кубано-Черноморской республики (созданной в мае 1918 года, после установления Советской власти на Северном Кавказе и Дону). Возомнив себя освободителями России, они организовали 8-10 июня совершенно неподготовленную десантную операцию в районе Таганрога, направив для этого несколько кораблей Черноморского флота и матросов-анархистов. Совместно с войсками Батайского фронта десант должен был освободить от немцев Ростов, что нарушало только что с таким трудом заключенный Брестский мирный договор.
Находившийся в Царицыне Сталин, как представитель центра, пытался отменить десант, но не смог… И десант на Таганрог состоялся. Поначалу все шло хорошо, но немцы, для которых десант оказался совершенно неожиданным, быстро подтянули крупные силы из Екатеринослава и Мелитополя и затем полностью уничтожили десант, положив на азовских пляжах около шести тысяч матросов. Произошла настоящая катастрофа. Более того, фактически во многом именно высадка этого совершенно ненужного десанта и явилась прологом скорой трагедии Черноморского флота. После Таганрогского десанта немцы стали намного белее жестки в определении судьбы собравшихся в Новороссийске кораблей.
При этом И.В. Сталин внешне фактически отстранился от решения вопроса по судьбе Черноморского флота. Он отказался выезжать в Новороссийск для организации затопления флота. За это его впоследствии критиковал один их эмиссаров центра в Новороссийске Ф.Ф. Раскольников: «Сталин был не в курсе нашего решения по Черноморскому флоту…»
Отказавшись от личного участия в судьбе Черноморского флота, Сталин переложил эту задачу на следовавшего тогда через Царицын наркома А.Г. Шляпникова, назначенного руководителем продовольственного дела на Юге. Видимо,