4 мая в постпредстве Армении в Москве прошла пресс-конференция председателя Верховного Совета Армении Л. Тер-Петросяна. Он заявил журналистам, что события в сёлах Чайкенд и Мартунашен – это государственный террор, который осуществляется по разработанному плану. Политические цели этого плана – удержать у власти в Азербайджане, единственном оплоте тоталитарного режима в Закавказье, Аяза Муталибова, а также прямой нажим на Армению, где успешно идут процессы демократизации и департизации. Центру больше нечем давить на Армению, кроме как ужесточением экономической блокады республики и нагнетанием обстановки в НКАО. По мнению Левона Тер-Петросяна, министр внутренних дел СССР Борис Пуго и командующий внутренними войсками Юрий Шаталин находятся в сговоре с Аязом Муталибовым.
В этот же день прошли переговоры Л. Тер-Петросяна с председателем Верховного Совета РСФСР Б. Ельциным, на которых Б. Ельцин обещал Л. Тер-Петросяну держать под своим контролем ситуацию в сёлах Чайкенд и Мартунашен и выслать в Армению специальную комиссию российского парламента для изучения обстановки.
4 мая в Армении был объявлен траур по погибшим в сёлах Чайкенд и Мартунашен. На ереванской площади Свободы состоялся многочисленный митинг, перед этим в ереванской церкви Святого Саркиса состоялось отпевание погибших.
Армянская пропаганда заявляла «о многочисленных преступлениях, совершённых против населения с. Чайкенд». Это мнение было сразу подхвачено и транслировано, в частности, спецкором газеты «Московские новости» Владимиром Емельяненко в статье «Свидетельствую: в Геташене была бойня». О многочисленных нарушениях прав человека в ходе проведения операции в районе сёл Чайкенд и Гарабулаг также сообщали правозащитный центр «Мемориал»33 и правозащитник Инесса Буркова.34 В то же время первый заместитель Генерального прокурора СССР А. Васильев сообщил корреспондентам газеты «Правда», что за всё время было два обращения: одно – по поводу убийства, другое – по поводу изнасилования. Оба сигнала были проверены и не нашли своего подтверждения.35
5 мая Президиум Верховного Совета Азербайджанской ССР выступил с протестом, в котором попытка созыва внеочередного Съезда народных депутатов СССР для обсуждения вопроса об НКАО и других районов компактного проживания армян в Азербайджане была охарактеризована как грубое вмешательство Верховного Совета Армянской Республики во внутренние дела Азербайджана, противоречащее статье 76 Конституции СССР, как намерение вновь обострить ситуацию в регионе, разжечь вражду между армянами и народами Азербайджана и к этим грязным действиям привлечь союзные властные органы. В документе отмечалось, что Армения уже четвёртый год ведёт необъявленную войну против Азербайджана, вооружённые бандформирования нападают на приграничные азербайджанские сёла, убивая мирных граждан, а также солдат и офицеров Советской армии и Внутренних