Жена президента Конфедерации Варина Дэвис писала в своих мемуарах: «То было любопытное зрелище – две противоположности стали друзьями – президент и военный министр. Это было постепенное сближение, медленное, но все более прочное». Джефферсон Дэвис и Иуда Бенджамин проводили вместе по 12–14 часов в день. Они как бы дополняли друг друга: нервный, импульсивный Дэвис и невозмутимый, методичный Бенджамин. Тысячи и тысячи документов – официальных инструкций, писем, телеграмм военным, дипломатам, политикам, издателям, известным людям – подготовил Иуда для главы Конфедерации. Не случайно Варина Дэвис называла его «правой рукой президента».
В ноябре 1861 года в восточном Теннесси вспыхнуло восстание противников Конфедерации. Партизанские отряды жгли мосты и разрушали железные дороги. Вдохновителем террора выступил «воюющий пастор» Уильям Браунлоу. В прошлом пастор был известен своими открытыми антисемитскими высказываниями. В 1860 году, когда Конгресс США пригласил раввина на открытие очередной сессии, Браунлоу сказал: «Если они пригласили одного из убийц Христа, их сердца и мысли готовы на все». Во время войны любимой мишенью методистского проповедника стал Бенджамин.
Арестованный за подстрекательство к террору, пастор был доставлен в Ричмонд. Браунлоу рассказывал об этом: «Меня вызывал еврейчик, который, как я полагаю, был военным министром фиктивной Конфедерации. Он угрожал вздернуть меня, и я не ожидаю от него милости больше той, которая была проявлена его пресловутыми предшественниками в отношении Иисуса Христа». В марте 1862 года Бенджамин выслал фанатичного проповедника за пределы Дикси. На Севере пастору устроили триумфальную встречу. После войны Браунлоу стал губернатором Теннесси, где продолжил свою длинную историю антисемитских выступлений.
Американский историк Ф. Л. Ослей справедливо отмечал, что «семена смерти» Конфедерации были посеяны в момент ее рождения, и этими семенами оказались права штатов. Главный идеологический постулат сецессии сыграл роковую роль в судьбе Юга: страна не функционировала как единый механизм. Военный министр Бенджамин настаивал на всеобщем военном призыве. Некоторые штаты возражали, соглашаясь содержать лишь местную милицию. Губернатор Джорджии Браун заявлял, что войска нужны ему для защиты собственной территории и отказывался предоставлять солдат в армию Конфедерации. Губернаторы Миссисипи и Северной Каролины также неохотно отдавали правительству свои ресурсы и солдат. Борьба за выживание всей Конфедерации мало заботила «местных патриотов».
Президентский кабинет и Конгресс раздирали противоречия. Многие из известных политиков