З моменту початку переселення національна ворожнеча між українцями та поляками зростала. З боку поляків почастішали погрози, випадки підпалів українських господарств, а також окремі вбивства українців. Селяни, боячись пограбувань і вбивств, змушені були переховуватися ночами. Головний уповноважений уряду УРСР повідомляв у Київ, що органи місцевої влади не вживають ніяких заходів, аби припинити насильство над українцями.
Перший період переселення закінчився влітку 1945 р. З 1 січня 1945 р. від лемків не було жодних добровільних зголошень на виїзд. Крім цього, тисячі осіб, які первісно зголосилися на переселення, згодом уневажнили це зголошення. Причиною такої зміни було, між іншим, те, що на Лемківщину повернулася частина добровільних переселенців, які виїхали до СРСР на переломі 1944–1945 рр. Їхні оповідки про радянську дійсність мали чи не вирішальне значення для зміни настроїв серед населення Лемківщини щодо перспективи життя в Радянському Союзі.
Щоб уникнути переселення, вдавалися до різних засобів. Аргументовано, наприклад, що в тексті польсько-радянського договору не говориться про лемків, а тільки про українців і русинів. Звичайно, цей «трюк» не приніс очікуваних результатів.
Представники лемків почали клопотатися перед найвищими органами влади. В Президії Ради Міністрів у Варшаві 24 липня 1945 р. відбулася зустріч з представниками українського населення Новосандецького та Ясельського повітів. Висунуто домагання, щоб лемкам, які бажали залишитися в Польщі, забезпечити вільний національний розвиток. Уряд пообіцяв, що не буде чинити тиску на національні меншини, але «ради спокою» буде краще, коли лемки переселяться до СРСР. При цьому висловлено натяки, що в майбутньому може виникнути потреба переселення українців на інші терени в межах Польщі [2, c. 245]. Насправді не лише польські комуністи, але й інші впливові політичні угруповання були згодні в тому, щоб українців з Польщі виселити цілковито. У вересні 1945 р., коли добровільних зголошень на виїзд до СРСР уже не було, політичні партії Польщі звернулися до українців із закликом покинути Польщу. Примусове переселення набрало великих масштабів. На допомогу агітаторам покликано відділи НКВС, завданням яких було створити атмосферу нестерпного терору і змусити населення до виїзду. У квітні 1945 р. через Лемківщину прокотилася хвиля арештів інтелігенції та свідоміших селян, зокрема священників. Заарештованих під погрозами і тортурами змушували підписувати заяви на виїзд.
Терор супроти населення Лемківщини посилився також через зростаючу злочинну діяльність різних банд. У першу чергу йдеться про групу грабіжників шовіністично настроєних селян польських сіл з терену Лемківщини. На основі повідомлень УПА ці групи створювалися з ініціативи НКВС, щоб таким чином утверджувати