Глубоко закономерно, что на ставшей возможной во многом благодаря твердой позиции митрополита Антония канонизации одного из величайший святых русской Православной Церкви преподобного Серафима Саровского в 1903 г. именно отцу Философу митрополит Антоний благословил произнести семь слов и поучений в различных храмах Саровского монастыря. Эти проповеди, вскоре изданные под названием «Саровские поучения протоиерея Философа Орнатского», принесли ему заслуженную славу выдающегося проповедника уже не епархиального, а всероссийского масштаба.
В 1905 г. в Русской Православной Церкви как среди духовенства, так и среди образованных мирян стало развиваться широкое движение в поддержку созыва не собиравшегося более двух веков Поместного Собора, на котором, по мнению многих сторонников этой идеи, следовало принять целый перечень решений, призванных глубоко преобразовать русскую церковную жизнь и активизировать роль Церкви в жизни современного общества. Ставший во главе этого движения митрополит санкт-петербургский Антоний, преодолевая значительное сопротивление со стороны оберпрокурора К. П. Победоносцева, стремился опереться в своей деятельности, направленной на скорейшую подготовку столь необходимого для Русской Православной Церкви Поместного Собора, не только на поддержку русского епископата, но и на традиционно игнорировавшееся в синодальный период приходского духовенства. В марте 1905 г. по благословению митрополита Антония отец Философ с группой священников Санкт-Петербургской епархии принял участие в составлении записки «О необходимости перемен в русском церковном управлении», в которой наряду с обоснованием необходимости созыва Поместного Собора предлагался перечень серьезных преобразований различных сторон церковной жизни, призванных активизировать роль Православной Церкви в жизни современного российского общества. Получивший впоследствии в церковно-исторической литературе название «3аписка 32-х», этот документ был опубликован в журнале Санкт-Петербургской духовной академии «Церковный вестник» и стал важным