Хотя большинство членов ложи «А.С. Пушкин» состояло в мастерских союза Великой Ложи Франции, в нее вошли и представители других масонских послушаний: Великого Востока Франции, Великой Ложи «Опера».
Предполагалось, что значительная часть членов русской масонской группы войдет в ряды ложи, однако добиться единой политики по масонской работе в России не удавалось. Например, Великий Восток Франции формально соглашался на создание единой русской мастерской в Париже, однако настаивал на том, чтобы работы в ней велись только по французскому масонскому уставу. Это стало одной из причин того, что не «Пушкину» было суждено сыграть серьезную роль в возникновении новых лож в новой России.
27 апреля 1991 году высокопоставленная делегация Великого Востока Франции, в составе которой были досточтимый мастер ложи L’Oeuvre Fraternel; член редакции журнала «Humanisme», историк А. Комб; отставной полковник А.Б. Липский и др. прибыла в Москву.
На следующий день (28 апреля 1991 года) в Подмосковье произошло открытие первой за долгие годы ложи на русской земле, получившей традиционное название «Северная Звезда».
В апреле 1992 года под юрисдикцией Великого Востока Франции была основана ложа «Свободная Россия», 11 июля 1993 года – ложи «Девять Муз» и «Северные Братья», а 12 июня 1994 года, в Архангельске, ложа «Полярная Звезда».
Для руководства работами в России 19 декабря 1992 года в Париже была создана «административная» ложа под названием «Григорий Вырубов», которую возглавил А.В. Липский.
В августе 1991 года, в Москву прибыла делегация Великой Ложи Франции, а 30 августа состоялась церемония открытия ложи «Николай Новиков». В 1992 году Великой Ложей Франции были открыты ложи «Сфинкс» в Санкт-Петербурге и «Геометрия» в Харькове, а в 1993 году – ложа «Лютеция» в Москве.
14 января 1992 года, при помощи членов русской ложи «Астрея», в Париже была основана ложа «Гармония», руководителем которой был формально назначен российский гражданин, философ по образованию Г.Б. Дергачев.
В сентябре 1992 года в Москву прибыла делегация из семи французских высокопоставленных масонов Великой Национальной Французской Ложи (в их числе были М.В. Гардер и великий секретарь Ив Трестурнель), которая 7 (8) сентября 1992 года инсталлировала, уже в Москве, регулярную ложу «Гармония», получившую в списке Великой Национальной Французской Ложи № 698.
В 1992–1993 годах в союзе Великой Национальной Ложи Франции были основаны новые ложи: в Москве – «Лотос» (12 октября 1993 г.), в Санкт-Петербурге – «Новая Астрея» (с 1995 года – «Астрея»), в Воронеже – «Гамаюн».
Рост числа «регулярных» масонов в России происходил благодаря посвящению новых членов и регуляризации масонов из союзов Великого Востока Франции и Великой Ложи Франции. Например, в 1994 году перешли в регулярный масонский союз многие члены харьковской «Геометрии» и петербургского «Сфинкса»,