Отечественной войны капитан Ф. Ф. Абашев 1 июля 1941 г. убыл из школы в действующую армию и был назначен командиром батальона 909-го стрелкового полка 222-й стрелковой дивизии, формировавшейся в районе Стародуба, Унечи и Трубчевска Брянской обл. К 10 июля она была передислоцирована в район Красного Рога (юго-западнее Брянска), затем к 28 июля – под г. Рославль, где, войдя в состав 28-й армии, заняла оборону на рубеже Криволес – русло р. Остер – ст. Крапивинская. 30 июля дивизия, обороняя г. Рославль, попала под удар частей 24-го моторизованного корпуса противника, в результате она была полуокружена и вынуждена отойти на промежуточный рубеж в район Екимовичи. К 8 августа ее части переправились на вост. берег р. Десна и заняли оборону по реке в районе нас. пунктов Старые Луки, Шатьково, Постушье, Ново-Спасск и Подворье. Позже она была передислоцирована в район междуречья Десны и Стряны, где в составе 43-й армии вела бои до конца сентября. 2 октября в ходе Вяземской оборонительной операции Ф. Ф. Абашев был ранен и эвакуирован в госпиталь. После излечения в ноябре он назначается начальником 2-го отделения штаба 28-й отдельной курсантской бригады. В составе 20-й армии Западного фронта участвовал с ней в контрнаступлении под Москвой, в боях на волоколамском направлении. В апреле 1942 г. направлен на учебу в Военную академию РККА им. М. В. Фрунзе в г. Ташкент. По окончании ее ускоренного курса с декабря состоял в резерве. В январе 1943 г. назначен зам. командира по строевой части 120-й отдельной Чапаевской стрелковой бригады ПриВО, формировавшейся в г. Чапаевск Куйбышевской обл. По завершении формирования она убыла на Брянский фронт в состав 21-й армии. В мае 1943 г. бригада была переформирована в 197-ю стрелковую дивизию, а майор Ф. Ф. Абашев назначен ее начальником штаба. С июля по октябрь 1943 г. временно командовал этой дивизией, которая в составе Брянского фронта участвовала в форсировании р. Десна и освобождении г. Брянск. За успешное выполнение заданий командования дивизии было присвоено почетное наименование «Брянская». С октября она в составе Белорусского фронта участвовала в боях по освобождению г. Гомель. В марте 1944 г. дивизия была выведена в резерв Ставки ВГК и сосредоточена в районе г. Нежин, где вошла в 3-ю гвардейскую армию 1-го Украинского фронта. Затем она была переброшена в район Луцка и участвовала в Львовско-Сандомирской наступательной операции. В августе 1944 г. полковник Ф. Ф. Абашев вступил в командование 197-й стрелковой дивизией, а с января 1945 г. 329-й стрелковой дивизией. В ходе Варшавско-Познанской наступательной операции (14.01.1945-03.02.1945) она в составе 3-й гвардейской армии вышла к р. Одер и захватила плацдарм на ее зап. берегу. За эту операцию дивизия получила почетное наименование «Келецкая», а за форсирование р. Одер – награждена орденом Красного Знамени. На заключительном этапе войны ее части успешно действовали в Берлинской и Пражской наступательных операциях. За окружение и ликвидацию гарнизона противника в крепости Глокау она была награждена орденом Кутузова 2-й ст., а за Берлинскую операцию – орденом Суворова 2-й ст. После войны в июле 1945 г., после расформирования дивизии, полковник Ф. Ф. Абашев убыл на учебу в Военную
