С точки зрения структурной организации, мозг состоит из двух частей: лимбической системы (подкорки, рептилоидной части) и коры головного мозга, которая фактически является надстройкой над первой, более древней, частью, присущей всем млекопитающим. Необходимо понимать, что у любых позвоночных, в том числе у человека, неокортекс эволюционно сформировался для обслуживания полового поведения и одновременно в качестве инструмента выживания. Даже у рыб есть следы этой надстройки над рептилоидным мозгом. У человека более сложное половое поведение, поэтому неокортекс представляет собой уже 6-слойную оболочку, располагающуюся непосредственно под костями черепа. Как следствие, все наше поведение, вся наша мыслительная деятельность так или иначе определяется через призму текущих задач полового поведения. Это обстоятельство нужно постоянно помнить.
Функционально мозг поделен на зоны, называемые полями, каждое из которых отвечает за ту или иную задачу и функцию: восприятие от зрительных нервов, вкусовых рецепторов, абстрактное мышление и т. п. Всего таких полей насчитывается около трехсот. Размер поля, количество нейронов и число нейронных связей, наличие необходимых нейромедиаторов и достаточное количество питательных веществ и кислорода определяют потенциал интенсивности, качества и разнообразия соответствующего функционала. Наименее активные нейроны гибнут на протяжении всей жизни, происходит это из-за отсутствия или однообразия поступающей информации, при длительном сильном стрессе, либо от недостатка питания. В таком случае, редко пропускающий сигналы синапс или даже сам нейрон с синапсами поглощается микроглией. Соседние нейроны могут создавать на его месте компенсирующие синаптические связи, что в этих условиях (слабой активности или недостатка питания) является энергетически оправданным решением. Однако в перспективе такой накопительный эффект ведет к упрощению мировосприятия и вызывает трудности в критическом осмыслении информации. Данный эффект наблюдается не только у пожилых людей, но даже и в молодом возрасте, когда по разным причинам человек не склонен задействовать весь мыслительный потенциал. Это касается, например, тех, кто приобретает привычку к упрощенному мировосприятию через призму той или иной религиозной парадигмы и даже тех, кто в соответствующий жизненный период не имел положительного опыта романтических отношений: как следствие, со временем восприятие людей противоположного пола в известной мере примитивизируется. Этим обстоятельством можно объяснить появление разного рода насильников, тиранов, убежденных холостяков и матерей-одиночек.
В рептилоидном мозге находятся низкоуровневые программы,