должность пом. начальника разведки 166-й бригады. В этой должности участвовал в Советско-польской войне 1920 г. В феврале 1921 г. переведен пом. начальника оперативной части 166-й бригады. В декабре направлен в Карелию пом. начальника оперативного отдела штаба Карельского боевого участка и в этой должности участвовал в отражении вторжения белофинских вооруженных формирований в Советскую Карелию. В марте 1922 г. вернулся в 166-ю бригаду, где назначается начальником пулеметной команды. В апреле 1923 – августе 1924 г. проходил подготовку в Высшей тактико-стрелковой школе комсостава РККА им. III Коминтерна. По возвращении в дивизию назначен командиром 3-й пулеметной роты 166-го стрелкового полка. С декабря 1925 г. командовал батальоном 166-го стрелкового полка . В августе 1926 г. переведен командиром батальона 127-го стрелкового полка 43-й стрелковой дивизии ЛВО. С сентября 1927 г. слушатель Военной академии РККА им. М. В. Фрунзе. После ее окончания в мае 1930 г. назначен начальником 1-й части штаба 4-й стрелковой дивизии им. Германского пролетариата БВО. С ноября 1931 г. начальник 1-й части штаба 5-го стрелкового корпуса. С декабря 1932 г. начальник штаба 4-й стрелковой дивизии. В ноябре 1933 г. переведен в г. Красноярск начальником штаба 94-й стрелковой дивизии СибВО. С октября 1936 по 15 августа 1938 г. слушатель Академии Генштаба РККА. Еще во время учебы 22 октября 1937 г. был назначен старшим руководителем кафедры тактики высших соединений, с ноября 1939 г. исполнял должность старшего преподавателя этой кафедры. 29 мая 1939 г. ему было присвоено ученое звание «Доцент по кафедре тактики высших соединений». 3 июня 1941 г. назначен начальником штаба 25-го механизированного корпуса ХВО. С началом Великой Отечественной войны корпус был включен в 21-ю армию и со 2 июля 1941 г. вел боевые действия на Западном, Центральном (с 26 июля) и Брянском (с 16 августа) фронтах. Участвовал в Смоленском сражении, в отражении наступления противника в районе городов Рогачев, Жлобин и Гомель. В августе корпус был расформирован, а полковника Н. Е. Аргунова назначили в штаб Брянского фронта начальником оперативного отдела. В ходе Орловско-Брянской оборонительной операции при отходе войск фронта он исполнял должность начальника Белевского боевого участка. В октябре был назначен начальником штаба 50-й армии и участвовал с ней в Тульских оборонительной и наступательной, Калужской наступательной операциях. В конце марта 1942 г. отстранен от исполнения должности и в апреле направлен в распоряжение Маршала Советского Союза К. Е. Ворошилова, где назначается руководителем группы контролирования за формированием стрелковых и кавалерийских соединений в военных округах. 9 октября 1942 г. генерал-майор Н. Е. Аргунов переведен начальником Разведывательного управления Центрального штаба партизанского движения, а 4 декабря – зам. начальника штаба Волховского фронта по ВПУ. Будучи в последней должности, одновременно с 30 декабря 1942 по 27 января 1943 г. временно командовал 376-й стрелковой дивизией. С 12 января 1943 г. ее части в составе 2-й ударной армии принимали участие в прорыве блокады Ленинграда южнее Ладожского озера. С 6 по 20 августа Н. Е. Аргунов временно
