исполнял должность начальника 1-го отделения – зам. начальника оперативного отдела штаба 52-й резервной армии, а в октябре назначен зам. начальника штаба – начальником оперативного отдела штаба 4-й отдельной армии. В составе последней участвовал в Тихвинских оборонительной и наступательной операциях, затем в боях по удержанию и расширению захваченных плацдармов на р. Волхов северо-западнее Грузино. С мая 1942 г. вступил в командование 288-й стрелковой дивизией. Ее части удерживали плацдарм в районе Водосье, Пертечно на р. Волхов. С сентября И. П. Алферов командовал 6-м гвардейским стрелковым корпусом в составе 2-й ударной армии Волховского фронта. В октябре корпус был выведен в резерв Ставки ВГК и сосредоточен в районе ст. Ртищево Саратовской обл. К 4 декабря он был передислоцирован в район Нижний Мамон, Осетровка, войдя в состав 1-й гвардейской армии Юго-Западого фронта. В ходе Среднедонской наступательной операции его части прорвали оборону противника и овладели нас. пунктами Филоново, Гадючье, Перещепное. Затем, преследуя отступающие на юг и юго-восток вражеские войска, они освободили Богучар, Дьяченково, Аипчанка, Медово. В период 22-24 декабря корпус совместно с частями 4-го гвардейского стрелкового корпуса участвовал в окружении и разгроме в районе Арбузовки и Журавки 8-й итальянской армии. Группировка врага была рассечена на части и капитулировала, около 15 тыс. солдат и офицеров были взяты в плен. В конце декабря 1942 – январе 1943 г. корпус в составе 1-й гвардейской армии вел наступательные бои на ворошилов-градском направлении, в ходе которых освободил г. Миллерово (17 января). В последующем он участвовал в Ворошиловградской, Изюм-Барвенковской, Донбасской и Днепропетровской наступательных операциях, в ходе которых были освобождены города Горское и Днепродзержинск. В конце декабря 1943 г. генерал-майор И. П. Алферов, сдав командование корпусом, был направлен на Ленинградский фронт, где 5 января 1944 г. допущен к командованию 109-м стрелковым корпусом. В составе войск Ленинградского фронта корпус участвовал в Ленинградско-Новгородской, Выборгской, Нарвской, Прибалтийской наступательных операциях. За умелое командование корпусом в Ленинградско-Новгородской наступательной операции генерал И. П. Алферов был награжден орденом Ленина (21.2.1944), а за образцовое выполнение заданий командования и проявленные отвагу и героизм при прорыве трех линий обороны противника на Карельском перешейке ему было присвоено звание Героя Советского Союза (21.06.1944). После войны корпус был расформирован, а генерал-лейтенант И. П. Алферов состоял в распоряжении Военного совета ЛВО и ГУК НКО. С января 1946 г. он командовал 7-м гвардейским стрелковым корпусом в ЛВО. С июня 1946 г. был пом. генерал-инспектора Инспекции стрелковых войск Главной инспекции Сухопутных войск. С января 1948 г. исполнял должность генерал-инспектора стрелковых войск Главной инспекции ВС СССР, с июня был старшим инспектором, а с марта 1949 г. зам. генерал-инспектора стрелковых войск Главной инспекции ВС СССР. С июня по октябрь 1951 г. находился на лечении в госпитале. 06.10.1951 г. уволен
