Финальным этапом сращивания партийного и государственного аппарата спецслужб стало образование 27 сентября 1939 года Reichssicherheitshauptamt – RSHA – Главного управления имперской безопасности – РСХА. Этим приказом гестапо и крипо фактически были вообще изъяты из рейхскомиссариата внутренних дел.
Вновь образованный чудовищный спецмонстр состоял из семи управлений (Amt).
В свою очередь, каждое управление состояло из нескольких отделов, каждый отдел – из нескольких рефератов (подотделов).
Из гестапо, крипо, а также внутренней и внешней службы безопасности были выделены все подразделения, занимавшиеся кадровыми и правовыми вопросами, учебой персонала и т. п. Из них было образовано I управление (Амт-I) РСХА (кадровые и правовые вопросы, учеба и организация). Возглавил Амт-I бригадефюрер СС, министериальдиригент д-р Вернер Бест. (В последующие годы Амт-I возглавляли группенфюрер СС Бруно Штреккенбах, бригадефюрер СС Эрвин Шульц, группенфюрер СС Каммлер, оберфюрер СС Эрлингер, штандартенфюрер СС Фраке-Грикш.)
Точно так же из всех спецслужб были выделены подразделения, занимавшиеся ранее администрированием, производством, снабжением и т. п. Они образовали Амт-II (организация, администрирование и снабжение). Глава – штандартенфюрер СС, профессор, доктор Альфред Франц Зикс. Впоследствии он возглавил вновь образованное Амт-VII – идеологическое, а его пост в Амт-II занимали последовательно штандартенфюрер СС д-р Зиккерт и бригадефюрер СС Шпациль.
Управление Амт-III составили оперативные отделы СД-Германия (иначе – имланд), а позднее и оккупированные территории. Возглавил управление оберфюрер СС и полковник полиции (впоследствии группенфюрер СС и генерал-лейтенант полиции) Отто Олендорф.
Управление Амт-IV составили оперативные отделы гестапо. Возглавил управление оберфюрер СС, полковник полиции и рейхскриминальдиректор Генрих Мюллер (впоследствии группенфюрер СС и генерал-лейтенант полиции).
Управление Амт-V составили оперативные отделы криминальной полиции (крипо). Возглавил управление оберфюрер СС, полковник полиции, рейхскриминальдиректор Артур Небе. (Впоследствии группенфюрер СС и генерал-лейтенант полиции.) После смещения Небе в июле 1944 года в связи с участием в заговоре против Гитлера начальником Амт-V был назначен заместитель Мюллера оберфюрер СС Фридрих Патцингер.
Управление Амт-VI составили оперативные отделы СД-заграница (аусланд, или внешняя разведка). Возглавил управление бригадефюрер СС и генерал-майор полиции Гейнц Иост.
После его ухода и.о. начальника управления исполняли оберфюрер СС Эрвин Веинманн и оберштурмбаннфюрер СС (впоследствии бригадефюрер СС и генерал-майор войск СС) Вальтер Шелленберг. 22 июня 1942 года Шелленберг был утвержден в должности начальника