В следующем, 542 году решающих сражений тоже не было. Велизарий собрал свою армию в районе Европуса на Евфрате, где ждал нападения, однако, если не считать одного набега, нападения так и не произошло, хотя Хосров и собрал все силы империи у Нисибиса. Римские хронисты приписывают его инертность страху перед репутацией Велизария, но представляется, что была еще одна причина, не менее важная. Великая чума 542 года пришла в Персию и, вероятно, стала истинной причиной отступления и роспуска армии Хосрова. Примерно так же в 1348 году «черная смерть» заставила англичан и французов прекратить на некоторое время боевые действия.
Эта страшная эпидемия заслуживает того, чтобы сказать о ней несколько слов. Она началась в Египте в самом начале года и со скоростью лесного пожара распространилась по Сирии, территориям вокруг Евфрата и Малой Азии. Оттуда она нашла путь в Константинополь и на запад. Невозможно точно назвать ее природу, известно только, что она сопровождалась ужасными язвами и вздутиями в паху. Мало кто из заболевших выздоравливал, но среди выздоровевших был и сам Юстиниан. Он встал со смертного одра, когда уже распространились слухи о его смерти и борьба за трон была готова начаться. В Константинополе чума свирепствовала с особенной силой. Утверждают, что каждый день умирали от 5 до 10 000 человек. Историк Прокопий дивился ее повсеместному распространению. «От чумы не было человеку спасения, где бы он ни жил, на вершине горы или в глубокой пещере, она находила его везде. Ей было все равно, север или юг, грек или перс, зима или лето. Она несла смерть везде и всем». Эта ужасная болезнь, унесшая, по некоторым оценкам, жизни трети населения империи, является не последней из причин всеобщего упадка в последние годы правления Юстиниана. Она унесла налогоплательщиков, остановила торговлю и заставила императора состариться до срока.
Таким образом, чума вполне объясняет застой в войне в 542 году. Возможно, следует также учесть личные проблемы Велизария, для которого предыдущей зимой настали не лучшие времена. Он уличил жену в неверности и, бросив ее в темницу и похитив ее любовника, навлек на себя гнев Феодоры, который сильно мешал его дальнейшей карьере, поскольку эта женщина имела большое влияние на супруга. Его больше не поддерживали из Константинополя, как раньше, и в конечном счете ему пришлось умилостивить Феодору, освободив жену. Слишком уж дурное расположение императора ограничивало его ресурсы.
В 543 году эпидемия пошла на спад. Хосров снова возобновил наступление и двинулся к Римской Армении вдоль долины Верхнего Евфрата. Однако новая вспышка чумы вынудила его повернуть назад, а римляне впоследствии получили возможность вторгнуться в Персармению (Нор-Ширакан). Велизария с ними не было, и они, потерпев серьезное поражение от находившегося в меньшинстве противника, бесславно вернулись