РГК, находившейся на формировании в Пензенском учебном лагере. В конце октября дивизия по железной дороге была переброшена на 1-й Прибалтийский фронт, в район Витебска. До января 1944 г. части дивизии прикрывали войска 39-й армии в ходе наступления на витебском направлении, при проведении Городокской наступательной операции. В январе – феврале 1944 г. дивизия осуществляла ПВО войск 11-й гвардейской армии в ходе боевых действий в районе Городка, затем прикрывала войска 6-й гвардейской армии западнее Невеля. В ходе Витебско-Оршанской наступательной операции 39-я зенитная дивизия РГК под его командованием участвовала в прорыве обороны противника северо-западнее Витебска, затем прикрывала войска фронта при проведении Шяуляйской и Рижской наступательных операций. Всего за 2 месяца боев части дивизии сбили до 60 самолетов противника, пройдя с боями до 400 км. За успешные боевые действия в этих операциях полковник С.И. Гайдуков был награжден 2-м орденом Красного Знамени. За успешное выполнение заданий командования в операциях на шяуляйском направлении дивизия была награждена орденом Кутузова 2-й степени. С марта 1945 г. дивизия входила в состав Ленинградского фронта и участвовала в ликвидации Курляндской группировки противника в районе г. Приекуле. После войны полковник С.И. Гайдуков продолжал командовать этой дивизией в ПВО (район Струги-Красные Псковской обл.). С января 1946 г. – заместитель командира 66-й зенитной артиллерийской дивизии в составе 4-й армии Бакинского военного округа, с октября 1947 г. – старший офицер 4-го отдела Управления боевой подготовки артиллерии ВС, с марта 1950 г. – начальник
