Правая часть храма была посвящена Минерве, а левая – Юноне, и у каждой из богинь был свой алтарь.
На протяжении столетий храм Юпитера оставался центром религиозной и светской жизни города. Ежегодно 1 января здесь проходила пышная церемония вступления в должность нового консула, а в середине каждого месяца (иды) в жертву Юпитеру приносилась белая овца. В сентябрьские иды здесь устраивалось грандиозное угощение для римского народа, в котором «участвовали» статуи трех богов. В храме находились и знаменитые тексты с записью предсказаний – так называемые Сивиллины книги, сгоревшие при пожаре в I веке до н.э.
Первый крупный пожар храм пережил еще в 83 году до н.э., когда был подожжен неизвестным «Геростратом». В огне этого пожара погибли и Сивиллины книги. Для ремонта святилища по приказу Суллы3 были привезены несколько колонн из афинского храма Зевса Олимпийского. После смерти диктатора работы продолжил консул Лутаций Катулл, при котором у храма появилась позолоченная кровля. Полностью храм был восстановлен при Юлии Цезаре и по иронии судьбы именно в нем укрылились после его убийства Брут с сообщниками.
Изображение второго храма было выбито на монете, где он предстает с шестью колонами по фасаду, украшенном тимпаном с изображением Рима и волчицы. На самом верху была установлена колесница с Юпитером, по обе стороны от которого возвышались Минерва и Юнона, а по краям крыши гордо сидели орлы.
В следующий раз храм подвергся разрушительному пожару в 69 году во время междоусобицы Вителлия и Веспасиана. Вскоре после прихода к власти Веспасиан восстановил здание, но заново освященный в 71 году храм уже на следующий год постиг очередной пожар. Восстанавливали его уже во времена правления сына Веспасиана – Тита Флавия Домициана, который повелел построить храм выше и изящнее прежнего. Теперь фасад включал колонны из пентиликонского мрамора, за которыми, как и прежде, находились три скульптурных изображения – сидящего на троне Юпитера, Юноны и Минервы. Центральная скульптурная группа на фронтоне осталась без изменений, тогда как боковые статуи заменили на две колесницы, одной из которых управляло Солнце, а другой – Луна. Сцену в тимпане украсили Вулкан, Ганимед, Эскулап и Веста, а по углам расположились Марс и Венера. Покрывала крышу