Камера царицы находится в центре пирамиды. К этой камере ведут две шахты, каждая из которых прорезает блок стены, но не до конца: они заканчиваются в пяти дюймах от внутренней стены камеры, оставляя то, что Смит назвал «зазором (left)». Эти загадочные шахты были обнаружены в 1872 году Уейнманом Диксоном, которому удалось засунуть прут в небольшую трещину в, казалось бы, цельной стене и который затем выдолбил проход в известняковой породе. Он обратил внимание на то, что на этом участке известняковый «зазор» особенно мягкий. Ободренный этим важным открытием, он отмерил такое же расстояние на другой стене и обнаружил еще одну шахту. Вскоре было высказано предположение, что это вентиляционные шахты; также была высказана мысль, что строители, хоть им и не нужно было проветривать камеру во время строительства, вели подготовительные работы на тот случай, коль вдруг впоследствии они передумают.
Шахта не может служить вентиляционным каналом, если она с обеих сторон перегорожена, как шахты Камеры царицы. В этой связи просто поразительно, что данное предположение вообще имело место. Даже если эти шахты были открыты с обеих сторон, то и тогда в силу своих конструктивных особенностей они не могли бы в должной мере служить вентиляционными шахтами.
Считается, что Смит первым обратил внимание на другую странность Камеры царицы – комки раствора, выступающие из стыков шахты. Анализ раствора показал, что это гипс – кальций сульфат. Смит также писал о том, что в камере стоит отвратительный запах, заставлявший первых посетителей камеры спешно ретироваться оттуда. Было высказано предположение, что туристы оправлялись здесь, хотя, судя по словам Смита, они едва ли успели сделать это. Неприятный запах вызван не антисанитарными условиями, это результат химического процесса, протекающего в Камере царицы. Одна из величайших загадок указанной камеры – это соляные отложения на ее стенах. Местами их толщина доходит до половины дюйма, и Питри учитывал данное обстоятельство, когда проводил измерения в камере. Соль также была обнаружена и в горизонтальном коридоре в нижней части Большой галереи. Как же она осела на стены?
Те, для кого наличие соли было немаловажным обстоятельством, предположили, что она осела на стенах при отступлении вод библейского Всемирного потопа. Другие выдвинули предположение, что в то время пирамиду Хеопса и другие усыпальницы фараонов окружала вода. Однако нет ни одного свидетельства в пользу названных предположений; кроме того, один исследователь, облазивший всю пирамиду в поисках оставленных водой следов, пришел к заключению, что подобные предположения не имеют под собой основания.
Теории потопа и грунтовых вод не объясняют образование соляных отложений, обнаруженных внутри пирамиды Хеопса; впрочем, их сторонники правы, пожалуй, в одном; присутствие здесь соли указывает на то, что в Камеру царицы должна была поступать вода, а не воздух.