Аудитор должен убедиться в наличии порядка такого раздельного учета в приказе по учетной политике для целей налогообложения.
При этом в соответствии со ст. 170 (п. 4, абз. 6) НК РФ указанный порядок должен предусматривать разделение «входного» НДС между облагаемыми и необлагаемыми оборотами исходя из пропорции, которая рассчитывается как отношение стоимости отгруженных товаров, деятельность по реализации которых облагается ЕНВД (освобожденных от НДС), к стоимости всех товаров, отгруженных за налоговый период (квартал).
По мнению Минфина РФ (Письмо от 29.10.2004 г. № 03-04-11/185), для обеспечения сопоставимости показателей в расчете пропорции стоимость отгруженных товаров следует брать без НДС.
Аудитор должен убедиться в правильности расчетов при осуществлении раздельного учета и в соответствии распределения НДС между облагаемыми и необлагаемыми оборотами полученному расчету.
Также аудитор должен обратить внимание на правильность заполнения книги покупок в этом случае. Согласно п. 8 Правил ведения книг покупок и книг продаж (Постановление Правительства РФ от
02.12.2000 г. № 914), счет-фактура должен быть зарегистрирован в книге покупок на ту сумму, на которую производится налоговый вычет, исходя из результатов расчета.
Для исчисления налога на прибыль организация, осуществляющая деятельность, облагаемую как в общем, так и в специальном порядке (ЕНВД), в соответствии с п. 9 ст. 274 и с п. 7 ст. 346.26 НК РФ обязана вести обособленный учет доходов и расходов по такой деятельности. При этом порядок ведения такого учета в НК РФ не установлен. В силу этого организация должна установить подобный порядок самостоятельно (например, аналогичный порядку раздельного учета для цели исчисления НДС), отразив его в учетной политике.
Для исчисления ЕСН при распределении между видами деятельности заработной платы (с начислениями) персонала, занятого как в деятельности, облагаемой ЕНВД, так и в деятельности, подпадающей под общий режим налогообложения, следует руководствоваться Письмом Минфина РФ от 01.12.2005 г. № 03-11-04/3/156. Согласно указанному Письму, в таких случаях налоговая база по единому социальному налогу в виде сумм выплат и вознаграждений, исчисленных по удельному весу выручки, полученной от видов деятельности, не переведенных на уплату ЕНВД, в общей сумме выручки, полученной от всех видов деятельности, определяется за каждый месяц, а затем путем суммирования налоговых баз по единому социальному налогу за каждый месяц определяется налоговая база, накопленная нарастающим итогом с начала налогового периода до окончания соответствующего месяца отчетного периода (года).
При этом в целях отражения в расчетах авансовых платежей и декларациях по единому