Еще при предшественнике владыки Нила епископе Иоанникии произошел неприятный случай. Миссионер Иранского уезда протоиерей Николай Курбановский в своем отчете заверял правящего архиерея, что все черемисы, находящиеся под его попечением, усердно исповедуют христианскую веру и колеблющихся или сомневающихся нет. Во время же объезда владыкой Иоанникием епархии неожиданно выяснилось, что «во многих подведомственных Курбановскому селениях черемисы держатся, и с упорством, своей старой веры». Безусловно, разразился скандал, информация о котором дошла до сведения Синода. И Синод запросил уже у владыки Нила мнения и информации о деятельности о. Николая. Епископ Нил сообщил, во-первых, что миссионер Курбановский уже был переведен из Царевосанчурска в Котельнич, а на его место назначен новый священник – Куртеев. При этом владыка сообщал, что не считает Курбановского виновным! После того как он лично посетил указанный район в 1836 году, ему удалось выяснить, что причиной всему явилась вражда между священником и местным исправником. Последний при посещении этих мест владыкой Иоанникием специально собрал на видных местах черемис и подговорил их кричать о своей прежней вере. Тем самым он вполне успешно дискредитировал священника. Вот что докладывал Нил в Синод: «Надлежало только собрать на известных пунктах толпы черемис и заставить хотя некоторых вопиять о старой вере. Так и сделано было: в этом лично сознался мне главный из действовавших при сем случае черемисин Никитин»[44]. Во время же поездки владыки Нила никаких манифестаций и собраний в пользу прежней языческой веры уже не было. Такое состояние народа, по мнению Нила, для Курбановского является лучшим оправданием и неоспоримым доказательством, что он неленостно трудился на миссионерском поприще и добросовестно доводил до сведения начальства результаты своих трудов.
Данная история вскрыла с совершенно неожиданной стороны целый ряд серьезных проблем в сфере церковной миссии. Как выяснялось, успехи миссии во многом зависели и от отношений между духовной и гражданской властями как в центре, так и на местах.
Важную роль в деле обращения инородцев в православие играли льготы, которые предоставляло Российское правительство еще с XVIII века. Согласно действовавшему законодательству, инородцам, принявшим христианство, предоставлялись льготы в платеже податей и отбывании рекрутской повинности в течение трех лет. Однако когда владыка Нил только прибыл в епархию, то ему сообщили, что льготная политика не проводится в полном объеме. Вопрос был настолько серьезным, что епископ Нил вынужден был уже в сентябре 1836 года обратиться в Синод за помощью. Владыка сообщал, что узаконенные льготы производятся с чрезвычайной медлительностью. Он даже предоставил список тех вотяков и черемис, которые уже больше трех лет не могли воспользоваться положенными льготами. Далее владыка по пунктам указывал на