Разработка и подготовка операции продолжались несколько недель. 20 мая ее план был подписан Антоновым к исполнению. Непосредственно задачей ставилось уничтожение Минской группировки противника путем фланговых ударов по группе армий «Центр». Наступательная операция продолжалось 2 месяца, завершившись полным разгромом противостоящих немецких войск.
А. И. Антонов (справа) и С. М. Штеменко.
С открытием 6 июня 1944 г. второго фронта в Европе появилась необходимость координации действий союзников, что для Антонова означало новые заботы и более широкий круг возникающих проблем. Обмен информацией с союзниками и согласование различных операций стали одним из ключевых направлений работы Антонова. Ему приходилось согласовывать объекты для бомбовых ударов, радиус действия союзных ВВС, определять сроки действий и направление усилий войск и флотов. Для достижения скорейших результатов в этой области были подготовлены советские предложения к Ялтинской конференции, открывшейся 4 февраля 1945 г.
В первый же день конференции Антонов выступил с подробным докладом об обстановке и планируемых операциях на советско-германском фронте. Помимо прочего, на конференции было решено всю работу по координации действий союзных войск возложить на Генеральный штаб Красной Армии в тесном сотрудничестве с главами военных миссий союзных государств в Москве. На конференции был поставлен вопрос о сроках начала войны с Японией. Антонову прямо в Ялте пришлось производить соответствующие расчеты, прогнозировать обстановку и определять, какими силами, в какие сроки можно будет нанести удар по Квантунской группировке. По предварительным расчетам дата наступления была определена как два-три месяца после капитуляции Германии. Интересным фактом в этом планировании является то, что при непосредственной подготовке Дальневосточной кампании корректировок в эти планы вносить не потребовалось.
Авторитет талантливого стратега был столь велик, что в 1943–1945 гг. в кремлевском кабинете Сталина Антонов был чаще прочих из руководящего состава Вооруженных Сил. Он пользовался большим авторитетом у Сталина, который, как правило, прислушивался к его рекомендациям в вопросах проведения стратегических операций.
В феврале 1945 г., с переводом маршала Василевского на должность командующего 3-м Белорусским фронтом, Антонов занял место начальника Генерального штаба. Приезжавшие в Ставку командующие войсками, прежде чем идти к Верховному главнокомандующему, обращались к Антонову за советом и оценкой подготовки боевых действий. Представители Ставки, направляя свои доклады Сталину, непременно адресовали их копию «товарищу Антонову», зная, что генерал предпримет по этим докладам все необходимые действия точно и в срок.
План Берлинской операции, подготовленный Генеральным