Существует особый порядок комплектования Суда. Десятилетний срок полномочий судьи исчисляется со дня его избрания (назначения). По завершении срока судья продолжает исполнять свои обязанности впредь до замещения места. Каждый судья обязан при вступлении в должность на заседании Экономического Суда принять присягу следующего содержания: «Торжественно клянусь честно и добросовестно исполнять свои обязанности, быть беспристрастным и справедливым, как велят долг судьи и моя совесть».
Структурные подразделения аппарата Суда действуют на основании Положений о них, утверждаемых Экономическим Судом, и работают в тесном взаимодействии между собой. Распределение обязанностей между сотрудниками структурного подразделения осуществляет руководитель этого подразделения.
При Суде действует Научно-консультативный совет; персональный состав и Положение о нем утверждаются Экономическим Судом.
Заседания Суда проводятся в зависимости от содержания заявленного в Суд требования, категории подлежащего рассмотрению дела и других факторов, следующим составом судей, число которых обязательно должно быть нечетным, Экономическим Судом, коллегией Суда в количестве трех и пяти конкретно определенных судей, коллегией Суда, назначенной Экономическим Судом для разрешения конкретного дела. Все решения, определения и постановления Суда, в том числе и Пленума, принимаются простым большинством голосов.
Суд работает постоянно, за исключением судебных каникул, сроки и длительность которых устанавливаются Экономическим Судом. Во время судебных каникул действует одна коллегия, состав которой определяется Председателем Суда, с необходимым количеством сотрудников аппарата. В период судебных каникул обязанности Председателя в месте пребывания Суда исполняются его заместителем или одним из судей по усмотрению Председателя. В экстренных случаях Председатель Суда может созвать судей во время судебных каникул.
Суд вправе в ходе подготовки дела к судебному разбирательству и в любой стадии судебного процесса обращаться устно и письменно к специалистам за консультациями, знакомиться с хозяйственной, правоприменительной и иной практикой. Суд не вправе публично высказывать свое мнение по рассматриваемому делу до принятия окончательного решения, а также не вправе давать никому советы и консультации по конкретным обстоятельствам, которые могут быть предметом рассмотрения в судебном заседании.
Суд рассматривает дела и разрешает споры на основе применимых норм материального права, включая: акты Содружества, акты органов и институтов Содружества, договоры и соглашения государств-участников Содружества, взаимоприменимые нормы актов бывшего Союза ССР, международные конвенции, как общие, так и специальные, устанавливающие правила, определенно признанные спорящими сторонами. Сюда же неизбежно