Возможны такие ситуации, когда одна из частей трансграничной геосистемы представлена агрогеосистемой, а другая – строго охраняемой природной территорией. В таком случае возникают отношения, характеризующиеся понятиями «устойчивое состояние» и «квазиустойчивое состояние» отдельных частей геосистемы. Дальнейшая динамика их состояний во многом зависит от правильной, экологически сбалансированной политики природопользования. Если в одной из частей трансграничной геосистемы состояние квазиустойчивости будет обостряться при несбалансированной природопользовательской политике, например, при крупномасштабном осушении земель или их распашке, то геосистема может достигнуть критического состояния и перейти в новый интервал устойчивости. Это, несомненно, скажется и на функционировании другой части геосистемы в соседней стране, что может привести ее через определенное время также в новый тип устойчивости, не всегда соответствующий состоянию устойчивости первой части геосистемы. Такой асинхронный механизм функционирования составных частей трансграничной геосистемы с сохранением их определенной взаимосвязи и взаимодействий в рамках целого является, по-видимому, основой для воспроизводства инвариантной системы функций или типа функционирования геосистемы.
Одним из характерных свойств трансграничной геосистемы является эмерджентность, в том числе приобретение геосистемой новых свойств, поддерживающих или нарушающих состояние ее устойчивого функционирования. Это связано и с многообразием способов воздействия на трансграничную геосистему при хозяйственном использовании, значительно отличающихся интенсивностью и формами воздействия по обе стороны границы, а также – со сходством ответной реакции геосистемы на эти воздействия. Достаточно часто наблюдаются ситуации, когда, например, лесные геосистемы в результате хозяйственной деятельности преобразовываются в агрогеосистемы. При этом происходит сокращение разнообразия структуры лесной геосистемы, часть ее приобретает новые свойства, связанные с функционированием нового типа геосистемы. Взаимодействие таких частей геосистемы с новыми свойствами в рамках исходной природной геосистемы происходит