16. 12 марта 2009 года российские учёные получили первые результаты генетической экспертизы останков лиц из окружения семьи Императора Николая 2. (по информации ИТАР-ТАСС со ссылкой на заведующего отделом Института общей генетики РАН профессора Массачусетского университета Евгения Рогаева. Несмотря на то, что окончательную точку в идентификации всех пленников Дома Ипатьева поставили 5 декабря 2008 года, а уголовное дело закрыли 15 января 2009 года, т.е. через три месяца;
17. 30 марта 2009 года погиб в автокатастрофе главный эксперт по «екатеринбургским останкам» Н. Неволин. Под его руководством экспертами был произведён сравнительный анализ образцов ДНК, выделенных из костных фрагментов «екатеринбургских останков» и образцов ДНК, выделенных из крови на рубашке Императора Николая 2 из Эрмитажа;
18. Август 2009 года – в Интернете появилось сообщение об опубликовании генетиком Е.И.Рогаевым в международном научной журнале (PNAS) проведённых им генетических экспертиз и результатов получения ДНК теста по крови из рубашки Императора Николая 2. [Электронный ресурс]. URL: [битая ссылка] http://www.pnas.org/content/suppl/2009/02/27/0811190106.DCSupplemental/0811190106SI.pdf (дата обращения: 13.11.2016);
19. 15 сентября 2009 года – по ТВ показали репортаж о том, что израильские генетики доказали, что ДНК тесты можно подделывать, при чём очень легко. Они провели эксперимент и доказали то, что ДНК можно подделать и по крови и по слюне. Так что 100% идентификация по генетической экспертизе может быть и 100% подделкой. Так как, зная исходно искомый код ДНК можно подделать такой же, но только синтетический. И отличить их друг от друга тоже можно с помощью определённых тестов. И ученые сделали выводы о том, что такая практика фальсификации, скорее всего, уже неоднократно использовалась мошенниками. Кроме того, взяв волос или иной материал у одного человека, можно подмешать выделенную ДНК в кровь или слюну другого человека и тем самым изменить его ДНК;
20. 20 октября 2009 года – Российскому Имперскому дому и Императрице Марии Владимировне Романовой было отказано в возобновлении уголовного дела по расследованию обстоятельств гибели Императора Николая 2 и его семьи, заявление она подала в сентябре в Генеральную Прокуратуру;
21. 9 октября 2009 года в британском журнале «Science» появилось сообщение о том,, что ученым удалось обнаружить ген гемофилии в останках, найденных под Екатеринбургом в 2007 году, предположительно принадлежавшем двух детям Императора Николая 2 (цесаревичу Алексею и великой княжне Марии (Анастасии)). Группу исследователей из Манчестерского университета возглавлял