Казацкое противостояние на Правобережной Украине заканчивается тем, что польский сейм в 1697-ом году отменяет постановление относительно казачества 1686-го года и запрещает ему размещаться в земских угодьях. Так Самусь начал постепенно втягиваться в конфликт с местной польской властью, который начался еще в 1688-ом году, и с тех пор олицетворялся с украинской стороны, главным образом, сопротивлением полковника С. Палия. Но пока существовала реальная турецко-татарская угроза овладеть Правобережной Украиной, верховная власть Речи Посполитой в лице короля закрывала глаза на претензии гетманов и полковников Войска Запорожского по установлению своей власти на Украине. Тем более что одновременно с «противлением» казаки продолжали уничтожать татарские отряды как на собственной территории, так и на вражеских землях.
В июле наказной гетман сообщил своим полковникам о смерти многолетнего патрона правобережного Войска Запорожского польского короля Яна Собеского, в связи с чем казачество начало волноваться о его преемнике, так как, именно благодаря этому королю, оно было обязано восстановлению на землях Правобережной Украины.
В течение долгого времени польская шляхта не могла выбрать себе нового короля, а потому Самусь все более открыто начинает общаться с гетманом Левобережной Украины И. Мазепой. Он неоднократно обращается к нему с письмами, которые содержали разноплановые сведения военно-политического характера. Статус наказного гетмана от имени короля не позволял Самусю переписываться с левобережным гетманом, и он договорился с С. Палием, чтобы тот передавал его сообщения Мазепе. Таким образом, Мазепа знал о том, что происходит не только на Правобережье, но и в Польше.
После того, как польский сейм все же смог избрать на королевский трон саксонского курфюрста Августа II, полковники правобережного Войска Запорожского во главе с Самусем сразу же заверили его в своей верности как «светлейшему Антессори». Гетман отправил в Варшаву к новому королю посольство, которое должно было решить различные вопросы функционирования казачества в пределах украинских воеводств Речи Посполитой.
Благодаря противоречиям между королевской властью и польским сеймом, решения и приказы короля не спешили выполнять в отдаленных украинских воеводствах.
Шляхта Брацлавщины жаловалась на то, что Самусь вместе со своими казаками собирает в имениях прибыль, а потому они просили центральную власть очистить их воеводство от «казаков». Чувствуя натиск местной шляхты и войск региментаря Б. Вильги, Самусь сообщал 21-го января 1699-го года из Винницы Мазепе: «Прошу, чтобы мне можно было с этого рубежа в те стороны за Днепр приближаться, ведь господа поляки хотят меня выгнать».
Вскоре так оно и случилось. Июньский сейм 1699-го года принял постановление об уничтожении «казацкой