Жила Матрона до войны на Ульяновской улице у священника Василия, мужа ее послушницы Пелагеи, пока он был на свободе. Потом жила на Пятницкой улице, в Сокольниках, в Вишняковском переулке в подвале у племянницы, квартировала также у Никитских ворот, в Петровско-Разумовском переулке, гостила у племянника в Сергиевом Посаде (Загорске), в Царицыно. Дольше всего (с 1942 по 1949 год) она прожила на Арбате, в Староконюшенном переулке. Здесь в старинном деревянном особняке жила односельчанка Матроны, Мария Жданова с дочерью Зинаидой. Именно в этой комнате три угла занимали иконы, сверху донизу. Перед иконами висели старинные лампады, на окнах – тяжелые дорогие занавески (до революции дом принадлежал мужу Ждановой, происходившему из богатой и знатной семьи, которого вымолила ей в свое время матушка).
Очевидцы рассказывают, что некоторые места Матрона покидала спешно, духом предугадывая готовящиеся неприятности, всегда накануне прихода к ней милиции. Времена были тяжелые, и люди боялись ее прописать. Тем она спасала от репрессий не только себя, но и приютивших ее хозяев, и непременно каждый раз благодаря Господа.
Много раз Матрону хотели арестовать. Были арестованы и посажены в тюрьму (или сосланы в Сибирь) многие из ее окружения. Сама Зинаида Жданова была осуждена как участница церковно-монархической группы. Неприятности грозили каждый день, каждый час…
…Как-то племянник Матроны Иван, который жил в Загорске, пришел к своему начальнику и говорит: «Хочу у вас отпроситься, надо мне срочно к моей тете в Москву ехать». Он приехал, не зная, в чем дело. А Матрона ему с порога и говорит: «Давай, давай, перевези меня скорей в Загорск, к теще своей». Только они уехали, как пришла милиция с обыском. И так было не один раз.
Но не всегда она избегала встречи с проверяющими. Анна Выборнова вспоминает такой случай. Однажды пришел милиционер забирать Матрону, а она ему и говорит: «Иди, иди скорей, у тебя несчастье в доме! А слепая от тебя никуда не денется, я сижу на постели, никуда не хожу». Он послушался. Поехал домой, а у него жена от керогаза обгорела. Но он успел довести ее до больницы. На следующий день на работе у него спрашивают: «Ну что, слепую забрал?» А он отвечает: «Слепую я забирать не буду. Если б слепая меня не предупредила о пожаре, я б жену потерял, а так я в больницу успел отвезти».
Живя в Москве, Матрона часто бывала в своей деревне – то вызовут ее по какому-то делу, то соскучится по дому, по матери, которую очень ценила и старалась всячески уберечь от неприятностей.
Внешне жизнь ее текла однообразно: днем – прием людей, ночью – беспрестанная молитва. Подобно древним подвижникам, она никогда не укладывалась спать по-настоящему, а дремала, лежа на боку, на кулачке. Так проходили годы.
Как-то в 1939 или 1940 году Матрона