В магнетарах, как и в обычных нейтронных звёздах, преобладает нейтронная материя. Однако здесь имеются дополнительные слои, состоящие из сверхпроводящего и даже сверхжидкого вещества. Это состояние материи возникает при экстремальных давлениях и температурах. В результате образуется особая форма материи, в которой нейтроны становятся свободными, что способствует формированию мощных магнитных полей. Модели этого процесса были смоделированы в ряде компьютерных симуляций, показывающих, как при увеличении давления и снижении температуры нейтронное вещество переходит в сверхжидкое состояние.
Поскольку магнетары обладают быстрым вращением, это влияет на их внутреннюю структуру и распределение массы. Благодаря эффекту коровой динамики мощное магнитное поле вызывает сложные взаимодействия между нейтронами и другими веществами внутри звезды. Эти взаимодействия могут создавать конвективные потоки, приводящие к дополнительным изменениям в магнитном поле. Анализ данных наблюдений различных магнетаров показал, что скорость вращения может достигать тысяч оборотов в минуту, создавая определённые узоры в магнитном поле.
Не менее важным компонентом внутренней структуры магнетаров является их термодинамика. Высокие температуры в центре заставляют нейтроны взаимодействовать на крайне критическом уровне. При достаточно высоких температурах (порядка 10^10 К) могут возникать термоядерные реакции, хотя и в ограниченных масштабах. Эта термодинамическая активность служит источником энергии для различных излучений, включая рентгеновские и гамма-лучи, которые становятся заметными в определённых циклах активности магнетара. Специфические температуры и места, где происходят такие реакции, могут быть смоделированы с помощью уравнений состояния нейтронной материи.
Структура магнетара также зависит от его магнитной среды. В центре находится область, где магнитные поля сильно деформированы, а на внешних слоях магнитные линии представляют собой относительно упорядоченную систему. Это приводит к значительным массовым эффектам, которые являются основой для формирования мощных вспышек. Недавние наблюдения магнетаров, таких как SGR 1935+2154, показывают, что места, где магнитное поле и вращение взаимодействуют, становятся центрами высвобождения энергии.
Моделирование внутренней структуры играет ключевую роль в астрономическом исследовании магнетаров. Современные компьютерные симуляции позволяют учёным отслеживать поведение материи, влияние магнитных полей и термодинамическое добавление