Каждый проект подводного корабля уникален и в зависимости от технического прогресса, возможностей страны и полученного опыта эксплуатации техники, происходила закладка на стапелях новых подводных лодок.
В официальную классификацию кораблей и судов Российского Императорского флота, утвержденную 30 декабря 1891 года, класс подводных лодок был внесен лишь 6 марта 1906 года (19 марта по григорианскому календарю) в соответствии с Указом императора Николая II, по которому они из разряда «миноносок» официально получили новый статус – Подводные Силы. Этот день подводники отмечают как день рождения Подводного Флота. За свою более чем вековую историю Подводный Флот прошел путь развития от «потаенного судна» с мускульным приводом до мощных атомоходов с ракетным и торпедным вооружением.
Русско-японская война 1904–1905 гг. стала основным толчком для принятия решения о создании регулярного Подводного Флота. Подводные лодки того времени – это маломерные суда, водоизмещением 100 – 600 тонн, способные погружаться на глубину 30 – 50 метров и находиться в подводном положении в течение лишь нескольких часов при отсутствии элементарных условий обитаемости и регенерации воздуха. Моряки в подводном положении дышали тем же воздухом, который выдыхали, что было причиной их плохого самочувствия, а зачастую приводило и к отравлению экипажа. Отсутствие же на подводных лодках водонепроницаемых переборок резко снижало их живучесть и непотопляемость, и любой снаряд, попавший в подводную лодку, или подрыв на мине неминуемо приводили к ее гибели. Формирование команд подводных лодок того времени проводилось сугубо на добровольных началах.
Обширен был круг задач, решаемый подводными лодками: они вели Боевые действия на коммуникациях противника, несли дозорную службу, вели разведку, ставили мины. Победы и освоение подводных лодок давались подводникам нелегко, многих из них море взяло к себе. Всего за период с 1907 по 1935 года Черноморский флот потерял двадцать три подводные лодки, восемьдесят подводников – черноморцев море взяло к себе.
Свое значение подводные лодки наглядно подтвердили в ходе Великой (Первой мировой) войны. В общей сложности за ее годы на всех морских театрах 600 подводных лодок потопили 237 боевых кораблей, судов торгового флота – общим водоизмещением около 19 000 000 тонн. Наиболее результативными были Боевые действия подводной лодки «Тюлень» на Черноморском флоте под командованием М.А.Китицына. Боевая деятельность подводных лодок Черноморского флота «Тюлень», «Нерпа», «Морж» и первого в мире подводного минного заградителя «Краб», навсегда вошли в историю флота.
После окончания Гражданской войны в составе флота России оставалось лишь 9 подводных лодок тип «Барс», поэтому Совет труда и обороны страны в ноябре 1926 года утвердил программу кораблестроения, предусматривающей строительство подводных лодок. К концу второй пятилетки было построено 137 подводных кораблей. Начали создаваться новые типы подводных лодок: «М», «Щ», «С», «К». С конца 20-х годов и до начала Великой Отечественной войны было построено 206 подводных лодок.
Вместе с тем, начавшаяся в конце 1939 года война с Финляндией вскрыла крупные недостатки в организации управления подводными лодками и их Боевого использования. Не последнюю роль при этом сыграли проводимые в стране репрессии, в результате которых было репрессировано 55 % командиров подводных лодок и 61 % командиров боевых частей подводных лодок.
В марте 1931 года в Севастополе была сформирована Бригада подводных лодок Морских Сил Черного Моря. В начале Бригада подводных лодок включала в свой состав два дивизиона: 1-й дивизион к лету оказался укомплектованным тремя новыми подводными лодками: Д-4, Д-5 и Д-6, в состав второго дивизиона вошли АГ-21, АГ-23, АГ-24, АГ-25, АГ-26 и «Нерпа».
В 1936 году Бригада подводных лодок получила пополнение из вновь построенных подводных лодок новых проектов и из ее состава сформировали две бригады. В состав 2-й Бригады вошел 21-й Дивизион (подводные лодки АГ-23, АГ-24, АГ-25, АГ-26, АГ-21, 22-й Дивизион подводных лодок (тип «М»), 23-й Дивизион (тип «Щ») с плавбазами «Красная Кубань» и «Эльбрус». 2-я Бригада базировалась на Кабаргу (район Очакова). 19 августа 1939 года подводные лодки тип «М» вошли в состав 21-го Дивизиона, тогда же переименованного в 24-й Дивизион подводных лодок.
К началу Великой Отечественной войны подводные Силы Черноморского флота распределились следующим образом:
1-я Бригада подводных лодок базировалась на Севастополь в составе: 1-й Дивизион подводных лодок: Л-4, Л-5 и Л-6; 2-й Дивизион подводных лодок: Д-4, Д-5, Д-6, С-31, С-32, С-33, С-34; 3-й Дивизион подводных лодок: Щ-204, Щ-205, Щ-206, Щ-207, Щ-208, Щ-209, Щ-210, плавбаза «Волга»; 4-й Дивизион подводных лодок: