В начале 1990 года Путина отозвали из заграничной командировки. Юрий Шутов, бывший помощник Собчака, находящийся уже много лет в заключении, утверждает, что Путин был возвращен в Ленинград из-за того, что «был замечен в несанкционированном контакте с представителем агентурной сети противника». Однако доказательств Шутов не приводит. Более убедительна версия бывшего шефа КГБ Владимира Крючкова, что «Путин был направлен на работу в ГДР на плановые пять лет, и после истечения срока вернулся назад, так как ничем себя не проявил, чтобы остаться для выполнения дополнительных проектов» («Московские Новости», 2000 г. № 3). Версию Крючкова об ординарности деятельности Путина в Германии подтвердил и Маркус Вольф, бывший шеф «Штази».
В 1991 году Путин уходит из КГБ. Сам Путин свой уход объяснил разочарованием, которое его постигло в период развала СССР и органов безопасности. По его словам, «он почувствовал, что уже не нужен стране». Возможно, что верны сразу обе версии: и Путин разочаровался в КГБ, и КГБ разочаровалось в Путине, не было смысла продвигать посредственного офицера. А если слухи о раннем провале Путина в Бонне в 1975 году верны, то засветившийся, арестованный агент был с самого начала выбракован, не мог быть употреблен в дальнем зарубежье, мог работать только в своих соцстранах, и потому грош ему была цена в базарный день с самого начала». [Конец цитаты]
Мнение о слабой работе Владимира Путина в КГБ разделяет Виктор Алкснис, бывший полковник ВВС СССР, позже депутат российского парламента (В. Алкснис. «Моль». Свободная пресса, 4 марта 2013 г.):
«Лет десять назад меня, как депутата Госдумы, пригласили принять участие в узком кругу в небольших посиделках, посвященных Дню чекиста. Собралось несколько бывших генералов КГБ СССР, а также приехавший из Германии их боевой товарищ и соратник – бывший генерал разведки ГДР. В ходе разговора всплыл этот "проклятый" вопрос: "Who is Mr. Putin?". Тем более что среди нас сидел человек, который в те годы, когда майор Путин служил в нашей резидентуре КГБ в Дрездене, был одним из руководителей "штази".
Генерал восточногерманской разведки ответил, что он его лично не знал, поскольку был одним из руководителей "Штази" в чине генерала, а Путин – рядовым сотрудником резидентуры КГБ, и они по службе никогда не пересекались. Но его непосредственный подчиненный контактировал с Путиным, и когда он ему задал такой же вопрос, то тот ответил так: "В наших документах он числился под оперативным псевдонимом «Моль». И этим псевдонимом все сказано". И один из присутствовавших на этом мероприятии генералов КГБ в ответ отметил, что немцы во все времена были отличными разведчиками и всегда умели замечательно разглядеть суть человека».
Маркус Вольф, бывший руководитель восточногерманской