Падение объёмов производства минеральных удобрений стало заметным в начале 90-х годов. Распад СССР и разрушение налаженных связей, новые экономические отношения между поставщиками энергии и сырья, производителями и потребителями удобрений, свободные цены – всё то, к чему старая экномическая система принципиально не была приспособлена, привели к глубокому кризису отрасли и разрушению внутреннего рынка. За период с 1988 по 1990 год объём производства минеральных удобрений сократился на 15 % и в дальнейшем продолжал снижаться [там же].
Ряд предприятий, работавших самостоятельно, были в несостоянии остановить дальнейшее падение производства фосфорсодержащих удобрений. Из-за отсуствия финансовых средств и изношенности фондов в конце 90-х годов XX века было прекращено производство фосфорных удобрений на Волховском алюминиевом заводе, Красноуральском медеплавильном комбинате, практически остановлено производство на Уваровском химическом заводе, Балаковском химзаводе ОАО «Иргиз». Постоянно снижалось производство и накапиливались огромные долги на Кингисеппском ОАО «Фосфорит», Белореченском ГУП «Фосфорит», ОАО «Невинномысский Внештрейдинвест».
Балаковский химический завод ОАО «Иргиз», как и ряд других родственных предприятий отрасли, могла ожидать незавидная участь, если бы в конце 90-х – начале 2000-х годов они не были интегрированы в одну вертикальную структуру «ФосАгро», объединившую фосфатносырьевую базу с производством удобрений. Так, получив финансовую поддержку, ООО «Балаковские минеральные удобрения» разработало инвестиционную программу, которая позволила не только стабилизировать, но и значительно увеличить производство удобрений. Уже в 1999 г. завод произвёл 124,7 тысяч тонн Р2О5, тогда как в 1998 году – практически прекратил выпуск удобрений [546, с. 5]. В последующие годы предприятие возродилось, как «птица-Феникс из пепла» и сегодня прочно удерживает лидирующие позиции в своей отрасли.
Миссия компании «ФосАгро» – создание новых ценностей в области производства минеральных удобрений и сельского хозяйства за счёт внедрения новейших технологий и увеличения эффективности труда. Наличие сырьевой базы ОАО «Апатит», продукция которого является основой для производства фосфорсодержащих удобрений России, накладывает на компанию обязательства по укреплению стабильности разработки