24 декабря 1796 г. получил чин командира батальона.
4 января 1797 г. – командир эскадрона.
Рана полученная при Ровередо не позволила Лемарруа принять участие в Египетской экспедиции.
После возвращения Бонапарта во Францию вновь стал выполнять функции его адъютанта. Участвовал в перевороте 18 брюмера в пользу генерала Бонапарта.
13 января 1800 г. произведён в командиры бригады (полковник), и возглавил 2-й конно-егерский полк, отличился в сражении 14 июня 1800 г. при Маренго.
Назначен командующим Северного побережья Франции.
…Кстати, 22.11.1801 г. он женился на Мари-Франсуазе Опсомер (ум. 21.12.1834), дочери Константена Опсомера и Мари-Франсуазы Амелинк. Их дети: сын – граф Жюль-Полидор Лемаруа (15.12.1802—3.04.1870), сенатор при Второй империи; дочь – Корали-Констанс-Элеонора Лемаруа (1805—24.11.1828)…
29 августа 1803 г., т.е. в 27 лет (!) он уже – бригадный генерал.
Принимал участие в Австрийской кампании 1805 г.
24 декабря 1805 г. (в 29 лет!) – дивизионный генерал.
6 мая 1806 г. назначен губернатором Анконы, Фермо и герцогства Урбино.
20 сентября 1806 г. вернулся в состав Великой Армии и принял участие в Прусской кампании 1806 г., был тяжело ранен в сражении при Йене.
С 21 октября по 6 ноября 1806 г. исполнял обязанности губернатора Виттенберга, успешно подавил восстание в Торгау.
9 ноября 1806 г. назначен губернатором Штеттина.
28 ноября 1806 г. – губернатор Тильзита.
5 по 15 декабря 1806 г. – губернатор Варшавы.
28 января 1807 г. возглавил главное депо Великой Армии в Варшаве.
7 марта 1807 г. избран в Сенат, а также стал депутатом Законодательного корпуса от департамента Манш, был одним из заместителей председателя этой Ассамблеи.
25 июля 1807 г. возвратился во Францию.
28 мая 1808 г. получил должность коменданта Фриуля, затем до февраля 1811 г. был губернатором Рима.
14 января 1812 г. назначен командующим войск в Булонском лагере, охранял побережья от возможной высадки англичан.
Не одобрял поход 1812 года в Россию, заявив, что в этом случае «не придется рассчитывать на возвращение в Париж, пока мы не доберемся до Китая, так как остановиться уже не сможем».
30 января 1813 г. – военный губернатор великого герцогства Берг.
27 марта 1813 г. – командующий 25-го военного округа в Везеле. 17 июня 1813 г. был назначен губернатором Магдебурга, храбро оборонял город от союзных войск, лично руководил несколькими вылазками, и сложил оружие только после отречения императора, по приказу нового правительства, после чего вернулся во Францию с гарнизоном крепости