Преследования Г.П. Башарина, всё, что случилось с ним и рядом других якутских учёных следует рассматривать не изолированно, а в контексте событий, инициированных публикацией в 1950 г. работы И.В. Сталина «Марксизм и вопросы языкознания».
Критика Г.П. Башарина в Якутии началась с появления в журнале «По ленинскому пути» – органе Якутского обкома ВКП(б) – статьи О.В. Ионовой3. В ней отмечалось, что оценки Г.П. Башариным взглядов С.А. Токарева и А.П. Окладникова, высказанные в его статье «Общественный строй якутов начала XVII века» нуждаются в пересмотре.
«Так, например, – писала О.В. Ионова, – положения Г.П. Башарина о том, что связь общественного строя якутов на Севере с общественным строем их южных предков относилась к периоду патриархально-родового быта, что общественный строй якутов вырос собственно на почве Якутии, что с XV века начинается складывание феодальных отношений в якутском обществе, что скотоводческое хозяйство, возникшее на Севере, коренным образом отличается от скотоводческого хозяйства их южных предков – все они требуют пересмотра в свете трудов товарища Сталина по языкознанию»4.
Критика Г.П. Башарина переросла в его преследование после публикации 10 декабря 1951 г. статьи в газете «Правда»5, перепечатанной журналом «По ленинскому пути»6. Этот номер журнала (за декабрь 1951 г.) был подписан к печати только 29 января 1952 г. Очевидно, якутскому партийному руководству потребовалось некоторое время, чтобы решить, как именно на эту статью следует отреагировать.
6 февраля 1952 г. Бюро Якутского областного комитет ВКП(б) приняло постановление «О буржуазно-националистических извращениях в освещении истории якутской литературы». Министр госбезопасности ЯАССР И.В. Речкалов7, прокурор Д.Л. Артёмов и секретарь обкома А.И. Захаров угрожали присутствовавшему на заседании бюро обкома Г.П. Башарину арестом. Это обстоятельство вынудило его, дабы избежать немедленной расправы, срочно вылететь в Москву8.
Г.П. Башарин был исключён из партии, лишён степени кандидата и доктора, было отклонено решение о присвоении ему звания профессора. В передовой статье майского номера журнала «Большевик» за 1952 г. отмечалось, что диссертация Г.П. Башарина «История аграрных отношений в Якутии с 60-х годов XVIII века до 70-х годов XIX века» содержит «ошибки буржуазно-националистического характера». Успешная защита её трактовалась как одно из свидетельств о «крупных изъянах» в работе Института истории АН СССР9.
В статье В.И. Дулова, опубликованной в газете «Известия» 9 апреля 1953 г. Г.П. Башарин обвинялся в том, что он защищал «реакционные буржуазно-националистические взгляды некоторых писателей дореволюционной Якутии» и в том, что «пренебрегая историческими фактами, он выдал участников белогвардейщины за представителей якутской общественной мысли»10.
Последующие годы были для Г.П. Башарина временем борьбы за отстаивание своего достоинства как человека и учёного.
На заседании Учёного совета Института истории АН СССР 6 июня 1955 г. рассматривался вопрос о повторной защите Г.П. Башариным докторской диссертации. В докладе учёный секретарь А.П. Молчанова поясняла собравшимся суть научных разногласий Г.П. Башарина с его якутскими оппонентами. Г.П. Башарин считает, говорила она, что «экономической сущностью патриархально-феодальных отношений в Якутии XVIII века являлась собственность тойонов на землю, на пастбища, на сенокосы». Наличие же скота «зависело целиком от собственности на землю». Якутские же оппоненты Г.П. Башарина полагают, что «аграрный вопрос, земля не играют большой роли в истории Якутии, так как земли там очень много и до сих пор масса свободных участков»11.
На этом же заседании директор Института истории АН СССР А.Л. Сидоров высказался за организацию дискуссии по вопросу защиты Г.П. Башариным докторской диссертации. Дискуссия должна была или «подтвердить сложившееся мнение», что работа Г.П. Башарина «не соответствует степени доктора» или «помочь ему реабилитировать себя в глазах научной советской общественности и стать на путь творческой научной работы в дальнейшем»12. Иного пути «выйти с честью» из ситуации инициированной, как считал А.Л. Сидоров, самим Институтом истории АН СССР, он не видел13.
На заседаниях Отделения исторических наук АН СССР, состоявшихся 27 и 28 марта 1956 г. под председательством В.И. Шункова обсуждалась рукопись подготовленного Институтом языка, литературы и истории Якутского филиала АН СССР II тома «Истории Якутии» (от присоединения Якутии к Русскому государству до 1917 г.) в 776 страниц (ок. 35 печ. листов)14. Том представили З.В. Гоголев и С.А. Токарев (ответственный редактор). На обсуждении выступили: