Осенью 1959-го года Анатолий Иванович послал в ЦК КПСС на имя Н.С. Хрущёва разработанный им проект создания общегосударственной автоматизированной системы управления для вооруженных сил и для народного хозяйства страны на базе Единой государственной сети вычислительных центров (ЕГСВЦ) – так называемый проект «Красная книга». В преамбуле этого доклада давалась резкая критика текущего состояния дел в стране с внедрением ЭВМ, и в первую очередь, в министерстве обороны СССР. Это предопределило негативное отношение к докладу А.И. Китова партийного и военного руководства СССР. Главное заключалось в том, что работники аппарата ЦК КПСС и, в частности, аппарата МО СССР почувствовали, что коренная перестройка управления на основе этого проекта приведет к устранению многих из них от рычагов государственной власти. В результате, А.И. Китов был исключен из КПСС и снят с престижной генеральской должности, которую он занимал в ВЦ 1 [11].
В 1965–1972 гг. А.И. Китов был Главным конструктором Отраслевой автоматизированной системы управления (ОАСУ) министерства радиопромышленности СССР и директором Главного вычислительного центра этого министерства. Потом около десяти лет он работал Главным конструктором АСУ «Здравоохранение». Опубликовал ряд основополагающих монографий и статей по вопросам применения ЭВМ и экономико-математических методов в области экономической информатики и медицинской информатики, в 1968-м году защитил докторскую диссертацию по гражданской тематике.
После ВЦ-1 в 50-е годы министерством обороны были организованы ВЦ-3 для разработки и исследования вычислительных систем и программирования авиационных систем, а также ВЦ-4 для артиллерийских и ракетных систем.
Отсутствие в стране в 50-е годы развитой централизованной промышленности электронных компонентов для ЭВМ являлось причиной их разработки зачастую теми же