В 1736 году, в ходе русско-турецкой войны, русские войска под командованием генерал-фельдмаршала Х.А.Миниха захватили и сожгли Гёзлёв, крепость была разрушена. После того, как Х.А. Миних и его солдаты покинули Крым, Гёзлёв был восстановлен, но спустя 35 лет, в 1771 году, в него вошли русские войска под командованием князя В.М. Долгорукова – на этот раз без боя.
После присоединения Крыма к России город Гёзлёв переименовали по моде того времени на античный манер, назвав Евпаторией в честь царя Митридата VI Евпатора, того самого, который когда-то направил своё войско на помощь грекам. В тот период многие проживавшие в Крыму, в том числе в Гёзлёве, христиане (греки, армяне) были переселены в Приазовье, а крымские татары эмигрировали в Турцию. Опустевшие земли и жилища за бесценок скупили караимы, представители немногочисленного народа, в быту придерживающегося мусульманских традиций, но исповедующего иудаизм особого толка: караимы признают Ветхий завет, но отрицают почитаемый «настоящими» евреями Талмуд, свод правил, которые надлежит выполнять правоверным иудеям. Таким образом караимы заселили и Евпаторию, постепенно превратив её в свой главный город, в неформальную столицу (прежде караимы обитали в горном крымском городе Чуфут-Кале, где они составляли большинство населения).
В 1854 году в ходе Крымской войны в Евпатории высадились англо-франко-турецкие войска. 60 тысяч интервентов отсюда отправились к Севастополю.
После Крымской войны Евпатория развивалась как курорт. Сначала процесс имел стихийный характер: между Старым городом (собственно, то и был бывший Гёзлёв) и Мойнакским озером хаотично возводились дачи. Но на рубеже ХIX-ХХ вв., когда городским головой был предприимчивый и дальновидный С.Э. Дуван, караим по национальности, на месте дач распланировали улицы новых городских районов, благоустроили пляжи, провели освещение. В те годы была заложена основа будущего процветания Евпатории как курорта.
В годы Великой Отечественной войны Евпаторию оккупировали немецкие и румынские войска. В январе 1942 года одновременно в трёх точках городской набережной (ныне это Набережная Терешковой) высадились красноармейцы. Это был знаменитый Евпаторийский десант. Вернее – его первая часть. Предполагалось захватить плацдарм на берегу, затем высадить основную часть десанта,