Деулинское перемирие 1618 г. положило конец иностранной интервенции в России, но не принесло ожидаемого конца бед для Боровска. В нем и Боровском уезде разразилась страшная эпидемия, умерли 2/3 их жителей. Вот почему в 1621 г. в Боровске на посаде остались только 54 жилых двора. Но со второй половины ХVII в. Боровск уже стал торговым и ремесленным городом и одним из центров русского старообрядчества (до 1917 г. 70 % жителей Боровска были старообрядцами). В 1776 г. Боровск стал уездным городом Калужского наместничества. В 1786 г. в нем открыли Малое народное училище (преобразованное в 1808 г. в уездное училище), стали открывать приходские училища при храмах. К началу ХIХ в. заметно упрочилось промышленное и торговое значение Боровска.
Отечественная война 1812 г. принесла новые беды Боровску, который заняли наполеоновские войска. Но зная о приближении неприятеля и отсутствии воинской силы для защиты, людей и ценности из города успели эвакуировать. Из Боровска вывезли казну, государственные бумаги, церковные богатства, жители покинули город. Наполеоновские мародеры бесстыдно ограбили и разрушили Боровск, устроили поджоги домов (сожгли 83 % зданий). 11 октября в опустошённый Боровск приехал сам Наполеон, он в нем не остался, а обосновал свою ставку поблизости, в селении Городня, где был вынужден принять решение об отступлении по разоренной им Смоленской дороге. Боровичане, жители Боровского уезда геройски боролись с захватчиками, которых стремились изгнать с их родной земли, мстили за занятый и разрушенный ими Боровск. Партизанское движение в Боровском уезде нанесло очень серьезный удар войскам Наполеона. Боровские партизаны 1812 г. убили здесь 2193 интервента и взяли в плен еще 1300 французов. 15 октября 1812 г. французы отступили от Боровска. Но город был разорен и сожжен (из 800 домов осталось менее 17 % строений), то же было в соседних селах и деревнях. С огромными трудностями боровчане возродили Боровск и окрестные селения.
В ХIХ в. постепенно наметилось и затем упрочилось развитие капитализма в Боровске и его уезде. Росло число предприятий, прежде всего текстильных парусных, ситцевых мануфактур, но основной доход боровчанам приносили все равно сбор грибов и огородничество. Сохранялись и традиционные кустарные промыслы. Мастера занимались выделкой бумажных и шерстяных платков, пуховых платков, бумажных фартуков, полотенец, одеял, также ткали полушерстяные и льняные ковры, плели кружева, делали тележки и сани, плели веревки, кроме того были развиты золотобойный, серебряный, кузнечный промыслы. Но наблюдалось и массовое отходничество на заработки (до 1/3 всего населения). Эксплуатация простых людей усиливалась, внимание властей к их социальным нуждам было крайне недостаточным. В конце ХIХ в. в Боровске